EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04152 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:4562149-4563735 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr12:4562632-4562652ATAGCATGAAGTCACGATTC+6.26
CTCFMA0139.1chr12:4563251-4563270TGACCACAAGATGGCGGAG+6.63
FOXD2MA0847.2chr12:4563338-4563351TTGTTTATTTAGC-6.12
FOXE1MA1487.1chr12:4563337-4563352GTTGTTTATTTAGCA-6.94
IRF3MA1418.1chr12:4563190-4563211CAGTTTCGATTTCCCCTTTTC-6.46
NKX2-5MA0063.2chr12:4563591-4563601ACCACTTGAG+6.02
SOX21MA0866.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-7.61
SOX21MA0866.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+7.85
Sox11MA0869.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-6.45
Sox11MA0869.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+6.9
Sox1MA0870.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+7.58
Sox1MA0870.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-7.95
YY1MA0095.2chr12:4563257-4563269CAAGATGGCGGA+6.27
Enhancer Sequence
AAAAAAGGGA TTAAGCCGAA AAGAAAATGA ATTAATGAAA GTCTAAAATG CCCCTAAATA 60
TCCATATATA TTCCTATTGT TGGCACACAA AAATGTAAAG ATTATCACAC ACATACTGTA 120
TATTGTGGTG TAGTGTTTTT AGAAAAGTTA CTTTAGTGAT TAATGTAGTA ATGTGTTTAC 180
AACAGCATTT ACTAAAATTA CCACAAACTA CTACATCATT GCAATTTATA ATTTACTATA 240
TTAAGGTTCA AACACACTTT CACATGTTCT ATCTATGTTC TACTTTCACA CAAACACATG 300
TTCTATAGTA AATTTACTCT AAAATACCAT AGTATTTTTT AATATACGCC AGCATTAAAC 360
ACATTTCTTT TAATGTCAGT GATTTAATTC ATGAACTTAA TATTATTAAC ATTTTCTAAC 420
ACATCCTAAA TGACACTTTA GTATTAAAAA TGTACATGTC TAGATAGACA GAAGGCATTA 480
CCAATAGCAT GAAGTCACGA TTCATATAAT GATGCAATCA CATACACTCA CTGTGATGCA 540
ACATTACAAC TACAAACCAA GTTGAAATAT CCACGTATGC ATATACAAAC TCTCACAACT 600
GCCACACATA TCCTAAAATG CAGTAAAATA TAAATCCGGA ATTACTATTT ATTATTATTT 660
CATCGTCTAG TTGGCTTGAC AGTAACGTTA ACGTTAGCCT ATAAACATTT TATGACAAAT 720
CGCAGAGGCC ATTTTAACTT CAAAAAGTGC ATGCATATAT TATTGAATAA TATGTATGTA 780
ATAAATAAAA CAATGTCATT GTTCATATAA TAACCCATTA ATACGCTACA ATAACAAAAG 840
TCCCGTGGCT GTCAATGGTA ACTTACCTTG CAAACAGAAG CGACAGTTGT TTGTGGCCTC 900
GTGTGTTTTC AGCGAGCTCT TCCTCAGATG TAAGAGATGT AAGTAGACAG AACTGCTTGT 960
CAATGTTGTT TTAATACTGA GCTTTATTCA GCAGACTGTG CTTTACGATC AGGTTTTAAA 1020
CATTACTCGG GAAACCCATA TCAGTTTCGA TTTCCCCTTT TCGCGTCATT ACACACGTCA 1080
CCGTAAGTTA TTTTACCCTG CATGACCACA AGATGGCGGA GACGACCATT AAAAAAGAAC 1140
GTAAACAACA GACGATTAAA ATGTGTTTTC GTGTGTGTCA GGCCTGTCGT TGTTTATTTA 1200
GCACTTTAAA ATAAGATTTA TTTGTTTATT GGCTACATTA AAAAATAACA ATGAACAATA 1260
CAGTTCACCC AAAAATGAAA ACTGTCATTA GTTAGCCTAC TTCCCTTTAC TTGTATTTCT 1320
TCACAAGTCT TTCTTCTGTT GAACACAAAA GAAGGTATTT TGAAGAATGC TGAAAACCGG 1380
TAACCATTGA CTTTCCTCAA GTTAATGGTT AGCGGTTTTC AAAACTCAAA AACATGTTTG 1440
GAACCACTTG AGGAAGAGTA CAAAGAGAGT AAATGTTGAT TATTGGGTGA ACCAAATTCT 1500
TTAATGTTCA TTTTCTTTTC GGCTTAGTCC CTTTATTAAT CAGGGGTTTC CACAGCAGAA 1560
TGAACTGCCA ACTCATCCAG TTTTTA 1586