EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04127 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:3477139-3478558 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:3477764-3477782GGAAGGAGGGACGGAAAG-7.5
RFX3MA0798.1chr12:3477996-3478012AATTACCATGGTAACC-6.16
RFX4MA0799.1chr12:3477996-3478012AATTACCATGGTAACC-6.18
RFX5MA0510.2chr12:3477996-3478012AATTACCATGGTAACC+6.08
RFX5MA0510.2chr12:3477996-3478012AATTACCATGGTAACC-6.15
ZNF263MA0528.1chr12:3477761-3477782GGAGGAAGGAGGGACGGAAAG-6.41
Enhancer Sequence
CCCATATGAA TTGTTTGCAA CCACTTACTT TAAAAATGTA AATCCAGTCA ATGATTTTTC 60
ACTGTTGATG AGTAGAAGAG GCTTTTTATC AATACATGAA ACTTACTAAT ATCCAATTGA 120
TTTTTTTACT TGATGGATGC AGCGTTTAAC ATTGCTAACG TCTTCAACTC AATAATAAAT 180
ACACGGTAAA CTGGCCAGAC GGTGAGTTTA GTTGACTAAA GTGAGTTTAT CAGTAGCCGG 240
AGTCTCCGCG CCACGAGGCC AAAAGTGATG TTTGGTGTCA GCCGACCTCG CGCCGCCTCC 300
CGCATGATAA CGAGCGGTTC TCTCGCGTCC CTCCCATGGA TATATGAATA AAACATGACA 360
TTACAGTCGG TGCAGGCAGA GGTTGAGCTG AGCTTCTGTC TGCGCGTCGC GTCACTGCAG 420
CAGAGCGTCG CGTTCATGTG ATTCTGCGCG CGCGCTCACA GATAAACACC GGCGATATTG 480
ATCTGTGGAG AAACGGAGAA ACCGAGAAAA ACCGGCCGAT GCTCAGCGCG GGAGTCTGCG 540
GGAGGAGGAC TGTGCTCAGT GTTTAGTGGA TGCTGGAGGC TGTCATGACA GAAATCACGA 600
GGAGGAAACA TTTCACGCGA GCGGAGGAAG GAGGGACGGA AAGTAAAAGA TAAGCGAGGT 660
ACGTGTGAGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TATGTTTGAA TGTGCGTCTG TGTGTGTGTC 720
AACCACAGCC AGAACGAGGC CAGAAGATAA GCGATGACGT TAATCTAGTA TAAAACCTGT 780
CATCCAGCTA ATTTCACACA GGCTAATGTT ACTGACATTA GTTAGAAATT TATCAATGGC 840
TTGTCTGTTT TTACCATAAT TACCATGGTA ACCAGTTTCT TCAGTTGTTG TACAACAATA 900
ACTCAACATA ACGTTTATTC GGTATTTCTT ATACAATGTT TTCAGAGACA CTTAATACAA 960
ACTTTCAGTT GGCAATAGCT GTATGCTACT TGATATTTTG GTAAAACGAT CACGTGGAAA 1020
ATGTGAGCTA ATTTTTATTT CATGTGTTTT TTGTTGTTGT TGTTGTTGTT ACTGGTTAAA 1080
TGTAGCCCAA TTAACCAAAA TCTGGGTTTT AGTAAAATGT TTAAAGGGAT AGTTCATCCG 1140
AAAAATAAAA TTTTTACTCT CTTAAGTAGT TCCAAACCTT CATGAGTTTC TTTCTTCTGT 1200
TGAACACAAG ATATTTTAAA GGGCACCTAT GATGAAAATC ATTTTTTGTA AGCTGTTTGG 1260
TCAGAACTCT TTCCACAATC ATATTGGAGT GATATAAAGA CAACAAGTAT GGAGTAAGAT 1320
CAGTCTCAAA AATATTGCCT TTACAAGATA AAATTCATAC ATGCACAGTT GCACACAGCA 1380
CAACTCAGCA CAATTTGCAA AATCTAAATT GTAAGTTTA 1419