EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:1206948-1208052 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:1207810-1207827TGATTTAATTAATTAAT+6.31
ArxMA0874.1chr12:1207814-1207831TTAATTAATTAATTGAT-6.2
ArxMA0874.1chr12:1207813-1207830TTTAATTAATTAATTGA+6.33
LMX1BMA0703.2chr12:1207811-1207822GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:1207815-1207828TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:1207812-1207825ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr12:1207817-1207827ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:1207817-1207827ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TAATTAGTGA GTAAATGTTC ATTTTTAGGT GAGCTGTCCC TTTAAGAGGG TTTGTATTCC 60
AACAAGTGTT GCTGCCGGGA TGCGCTCGCT CCAACCAACA CTCCACTGAT TACTACAGCG 120
CTCAGCTCAG AGGACTGAGG AGAGAGAATC TGAATCCACA CTGAAGAAAA CAACATCACA 180
GGTGCACACA GGAGGAGAAT CAACACAGAA GCACGCGCAA AATTGCTGGA AATCAACACA 240
GAAGCACGCG CACGTTGTTG GAGCGGAATT GCGCGCACTA GAAATTGGTA CTCTTTATTT 300
TGAGCGCAAA AACCAGAAGA CATGCGCATT CAGGGGGTGT CGATGAAAAG TTAATTCTCG 360
CGTACTAAAA CAAGACAGAT TGATTAGAGG AAAGTGACCT GCATCACGCA GCGAATTACG 420
GACAGTTTGT GAATAAAAGT GACCGCATTA CGCAGCGCAT TAATCACGCG TCGCGCCAAA 480
TCGATTACTA AAAATATTTA TATATAATAA TAAGGATGTC GAGGAAAAAA GCGCTGAAGG 540
GGAAGGGCAG TTCAAACACA CCGAATTCAT CTCCGAGCGC TGAAAAAGAG AAGGGGAAAA 600
AAGTGTCGAG CCAGGCGAAC GGAGTGGTTC ATCCCAGCCG GCCATCTCTC AGCAACAGCG 660
GGGAGTTCTA CGACATCGCA TTCAAGGTAC ACAAGGCTAA ATGGCAAGCC GGGTTTACAT 720
TCATTCTGCT CATTAGTGTT TCTGGTTGAT TGTTTTATAT TGTTCAATGA CTACTCTTGA 780
CACGCTCCCT ATTGTTTAGC ATTGAGTATT TGGTCTGAAA TCACATGCAA GAGACTTCAA 840
CACAACATCA GCACTGTTTA TTTGATTTAA TTAATTAATT GATATTTAGA ATTTGCAATT 900
CATGCTTTTC TGAAAATGTA TTATTAAGGA GAAAGTCTGA ATGTAAAACC AACTTTACCT 960
CAGTTTTTGT TTATAGTGCT TGTACTCTCT GACACACGCT ACAGACCATT TTGAGGCATG 1020
TAAACAATAA CAATCGTACA TTTTAGATTT CCATAGCGTC CAAAAAAAGT ACCACATATT 1080
GATAAATAAT GTTACGATTG CTGC 1104