EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04074 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:953011-953959 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr12:953378-953389TATAAACAATA-6.32
PBX2MA1113.1chr12:953633-953645CTGATTGACAGG+6.62
PBX3MA1114.1chr12:953631-953648AGCTGATTGACAGGCCT+6.22
POU1F1MA0784.1chr12:953498-953512TATATGTTAATGAG+6.01
POU2F2MA0507.1chr12:953071-953084AAATGCAAATGAG-6.28
POU2F2MA0507.1chr12:953116-953129ACATGCAAATGTG-6
Rarg(var.2)MA0860.1chr12:953902-953919TGACCTCAGTTTACCTC-6.01
SP1MA0079.4chr12:953299-953314AGTGGGCGGGGCTTT-6.69
SP2MA0516.2chr12:953298-953315TAGTGGGCGGGGCTTTC-6.98
SP4MA0685.1chr12:953297-953314CTAGTGGGCGGGGCTTT-6.42
ZNF24MA1124.1chr12:953557-953570GAATGAATGAAGT-6.06
Enhancer Sequence
CTAGCTCTCG GAAACAGACC CTTTCAGGCT TAATTGTGGC GTTTTGGTGA CTGTCACTTT 60
AAATGCAAAT GAGATCAGGC TTTTTTTAAA AGAGGGCGGA GCTACACATG CAAATGTGCT 120
TCATGCTTCT GTCAGTCTAT GTCGCCATTC ATCTAAAACT CCTCATCTAT AATCCTCTTA 180
GTCTATGCTG ACATTATTTT CAGCAGCTTA AACACTAATG GCTAATGGAC AGGCGGCTGC 240
TTCTCACTCA GGGCTGCTGT TTATGGTAAT GAGGGAGAGA TGGGCACTAG TGGGCGGGGC 300
TTTCCCTTTC TGATGACACA TAGAAAGGGA GAACGTCAAT CGAAGTGTTT CATTCATCAA 360
GTCTGATTAT AAACAATAGA TTAATTCATG TAGATTCACA AATATCTGAC ACACAACTGG 420
GGTAAACCCC ATATAAAAGC GAGTTTTGCA TATTAGCTGC CCTTTAAGTC ATTATAATGA 480
GCGTCAATAT ATGTTAATGA GATCCTGCCG CCACGTCAGA GGTCAGAGTA ACGCATTAAT 540
CAATCAGAAT GAATGAAGTC ACTAAAAGTT AGTCATCTAC CAGCAGATAA CCAGCCCAGT 600
GCAAAGCTCC AAAGGGAAGA AGCTGATTGA CAGGCCTTTA GTTAGTTCAA AACATGCATT 660
AAAAAGCTCA GGAATCATTT AAATGAGGCC TAGCATTGGA GAATGAGCCT AAATAAATAT 720
ATCAGACACA CAAACTTTCG CTAACCTTAT AGCAAAGCAC ACATACACTT AAAATTACCC 780
CTAAGCAGTG CACGAGTGGG TATCCCCGTA CTACAATTAA CCTTTAAAGT TAGTAAAATA 840
GCCTAAAATT AACCTAGTAA AACAGTAAAC ATATATTGAC TTACATTTGT ATGACCTCAG 900
TTTACCTCAG TGGTAAAACT ATGATTAGAG GTGCAAAACT CCAGTAAG 948