EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04073 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:943736-946456 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr12:944085-944100TGAACTTTGATCTCA-6.45
Hnf4aMA0114.3chr12:944083-944099GCTGAACTTTGATCTC-6.09
PHOX2AMA0713.1chr12:944665-944676TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr12:944665-944676TAATTGAATTA-6.14
RFX1MA0509.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RORA(var.2)MA0072.1chr12:944583-944597TTGACCTACTTATT-7.82
RORCMA1151.1chr12:944584-944596TGACCTACTTAT-7.22
Enhancer Sequence
TAAATAATAA TTGTTTGCAG TATTTTGAAG TCCCCACGAT ATCAATATTG TGAATTTTCG 60
TTATGCCGAT ATGTCGAATT ACAGAGTAAC GATAAAGTAC ATCACAACAG CAGGATATCA 120
ATCATAGCAT TATGAAAAAA CACTGTAAAT ACAACAATCC CAGTATTGTT AAAAGTTTAA 180
ATGACAATTA TTCGCGGTAT TTTGAAGTCC CCACGATGTC AATATTGTGA ATGTTCGATA 240
TCACGATATA TCGAATGACC GAATATCGGC GTATGTCTGG TAACGCTACA GTATGTCACA 300
ACAGCTGGAT ATCGATCGCA AATAAAGGCC ATAAATAAGA TAAATAAGCT GAACTTTGAT 360
CTCAATCTCA CCACACAGCC CGGATAAACA GCTCGAAGGC TCCGGGAAAC ACCAGATCAT 420
CACTGGCGAT CCGCCACCGG CGCCCGAACA CCAGCAGTCC GGGCATCCCG ACAGATAAAG 480
ATAAAGATGA TCACAAATCG CACACACTCC CGGTCAGCGG CGTCCTGAAG CCCATCTCCC 540
CGCCACCCTG CGCTCCATTT CCGGATTATA ATATTACGAC ATGGGGGAAA GTATCATTAG 600
CATCGCTCAC TGACATCTGA CAGGACAAAC CGCAGCTGCT TGGGTTTGTT GTTTTCCCTT 660
TTCTGTGTAG CAACCAAATG TGTCCGTGAG TAGACGTTTC GGCAGCACAA CAGTTCCGAG 720
AGTAGCAGTT ATGAACATTA TTTATTAAAT TACTCATTAA TTGTATTTTT TAACGTCTAC 780
CCCTTCCCCA ACTCTAAATC TACCTCTCAC ACTAAATTAA AACGGTCATT ATAACGAGGA 840
TTTCTAATTG ACCTACTTAT TAATTGTATT GTATAATCGC GTACCCCTGC CTCAAAATAA 900
AGTAAAACAG TAAATAAAAA GAGAATTATT AATTGAATTA CGGATTAAAT TGTATTTTAT 960
TAACGCCTAC CACAACCCTA ACAATCACTG AAATGTAAAA CAGTAATGAT ACTAGGTATT 1020
ATTCACATTA TTTATTAAAA TTGCTCATTA AATGATAATT TATTAACGTC TACCTCTACA 1080
CCAACCCTCA CAGTAATGCA AAACAGTAAT TATACCGAGT ATTATTGATA TTATTTATTA 1140
AATTACCCAT TAATTCTATT TTGATAACAT CTACTGTTTA CCGAAACTTC GGGCCGCAGC 1200
TGTATCCCTT CTAGACTTTA CCCGGACACA TTTGAGGAGA CACTAGCTCC CACTGCTCAG 1260
CCGTAATTTT ATTTATTTAT TAATTTTACT GTTCAGAATA TACATATATA ATGGCACTGA 1320
CGAATATAAT ATAGCAAATA TTAAGCAAGG CACATACACA ATTGGACAAT GAACCTGTAA 1380
ATTAAAATAA TTAGAATATT TCATCATGTT GGGCACTAAA ACCACCAGAC ACTCGCTGTA 1440
GCTCTGATAA ACGTTTTATT CACTAAAAAA CTACGTGCTC TGCGTTTGTC TGAGTTAATA 1500
AGTCTACCTT TATAGCTGAA ATGATCAAAT ATTACAGTTA TTTATAGTAA ATATGTAGTG 1560
TTTTGGATAG TAAAGAGCTA TAATCAATCC GTTGTGGTGA TTCAGTTGCT ATGGTAACAC 1620
ATTCATTACA GTAATATAAA CAAATGACCC AAAACTGTAG TTTTCTACAA ATGTAAGGTC 1680
TATTTGAACA AATACTATAG AGCATTGCTG TGTATTATTC TCCAAACATC CTTTGTTTCC 1740
CAAGAAAACC CTTATTTGAG TCCCCCTGCA AAAGCCAATT CAAAACCCCT GATAGCAAAA 1800
TAAAGTGATA ATTGTGATCA AATTGTGGTG TATATTAAAA ATCAGCTGTA TTATCAAAAA 1860
CTCCAGTGAA ATTAAATGAC TTTTTTCAGA TGTTAGTATC AGTATATTAG ATTTAAGGAT 1920
GTCTACAATC TAGTGTGCTC CAAAAACAGT GACAAAAATC ACATTTATTA AATATAACCC 1980
TGTTTGAAGT TGATCTCTTC TGTCTAAATC ATACCTGCCA ACATTTGTCC CTGAAAATCC 2040
GGGAGACCGG GGTTGGAAGT GAGGTGTCTG AATAACATTG TTGTGAACCA GGTGTACTGT 2100
GGTGATTGTA ACTACTATGA AGCATGTTTC GGGCCGCCGC TGCGATCAGA CCCAATATAT 2160
ACCAATACAT TGGATCCGAT ATACCATTTA CCAATGTTGG CAACCCGGGG GTTTCACAGA 2220
CCGTACCAAA TTGCTGAGGA CTGCGAGGGG GTGGTTGAAA TTACGGAAGT TTTCCGGGAT 2280
AAATAACAAA ACGGGAGGGT GGCGGGAGAT GGGTTGGAAA TACAGGAGAC TCCCAGGTAA 2340
AACAGGAGGG TTGCCAGGTA TGACCACAAT GGATATTTTT GACGTCACCT CATACTGCAG 2400
TTTCTCATCG AATCTTCTGC CCAATCAAAT GCACTCAGGT GTCTGAAATG CCCCACCCCT 2460
TTCTTCTCAT TGGCTTTTTA ATTTGATGTG CTCAAGCTCA ACCACTCTCA CTGGCAGAGT 2520
GGTGATAAAA CAACAGCTAT TGGCTGTTAT TTAAAAAGAG GGGAGCTGAT ATATGCCCCG 2580
CCCATAGGTG GAGGGTGAAC AAACTCCAGG GTAAGGCTAA TATACGCGCT GCCCTTTAAT 2640
GCGCTTAAAC AGATTTGCGA CCGACAAAGA AGAGGTTTTA ACAAAAGCAA CAAACGTCTA 2700
TTATACTCAA CACGCACATT 2720