EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04068 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:688914-690623 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr12:690082-690095ATGTTTATTTAGC-6
FOXE1MA1487.1chr12:690081-690096TATGTTTATTTAGCA-6.01
Foxd3MA0041.1chr12:690080-690092GTATGTTTATTT+6.11
Gfi1bMA0483.1chr12:689132-689143AAATCACAGCC+6.02
SP1MA0079.4chr12:689392-689407AGTGGGCGGGGCCTT-6.51
SP4MA0685.1chr12:689390-689407AGAGTGGGCGGGGCCTT-6.92
ZSCAN4MA1155.1chr12:690159-690174TTTACAGCATGTGCA-6.44
ZSCAN4MA1155.1chr12:689324-689339ATTTCAGTGTGTGTT-6.5
Enhancer Sequence
ATTTAGTTAC ATTCATGTTC TTGTCTCTTC TTGTGAAATA AATAAATGAT CTTATAATGA 60
AGATGTGTTT TCATTCCTCG CAATAACACA CCATGAAATG TTTATTTTGG CAGTCTGCAT 120
TGTTTGGTGA ACAATTAATC TATGCATGTT AATCAGAAGA GGAGTGTTTG TTTGTTAATC 180
TTTAAATAAA GTCTGTCTGT CTGCACCGAA AATAAAACAA ATCACAGCCA TTTTATTTAA 240
GTTGGTTCAA AGTATTTTTT AATGTAGCTA TAGTGTATTT TCTTTAAACA TCTACATTTT 300
TGATCAGTTT ATTTTAAGCT AGAATTATCT ATTAACTCAA GAAACGCAAT GCTTTGCTGC 360
ATATTATTAG TTTGAGAAAA CATTAATACT GATGACTATT TTTATAAGTT ATTTCAGTGT 420
GTGTTTTTTC AGTGTATAAA TCCGTGGCTC GCGCGCGCAC ACACACACAC ACACACAGAG 480
TGGGCGGGGC CTTCGTGTCA TGACAACCTC CAGTAATGTA CCAAACGCTG GTGTGTAGAC 540
TGTACCGAGG GAAAGTAAGT AGCCGTACAC GTCATCCGCG CTCCCGTGGG AGGAGGGTTA 600
GGAACCTGGA GCTCAACTAA TAACAGATTA TCCTCCATCC GTCGATGCAG TGTGTGTGTT 660
TGGTCCATGA TCGTGTGTGT GAAGAAGAAG ACGAAGAAAA GCTCCGCAGC AGCAGCGAGC 720
CGCCGCCACA TCCTCCCCGC CTGAAGAAGA GCCGCGCCGG GCGATGGAGC ACCTCTGCGG 780
CCCCGACAAA CCCTTCTGGG TGAGTACAGC TCCACAGCAG CTCCCTCAAC ATTAATATTG 840
ATCATTATGG GTCTGTTTCA TTCACTCTTA CTGCACTAGC GAGTTATGAG GTGCTAAACG 900
GCTCTCGAAC TTACTGTTGC AAGTAGTTAA TGCGCGAATA TTGTCAACTT TTGCTGTGCG 960
GATATAGGCG GAGATTCGCT GCTTTGTGGA TTAAAACATG TTAGTTGGCT TTAGTTGGTA 1020
TTTTTTGATT GTCGTAAGTC TTCATGTATG GGTTTGATAA CTAATGAACC GATTCACCAC 1080
ATCGTTCACT AATTGGTCGA CTGACCTGTT CGAATCTCAG TGATTCGAGT TCAGAGGAAC 1140
AGGAGAAAGT TGAGGATAAT CGGTGTGTAT GTTTATTTAG CATTTTAAAT AAGATTAAGA 1200
TTGTAATATA TTACCTTTTG AGTTTATTTG AACAGTTGGT CCTGTTTTAC AGCATGTGCA 1260
GTGTGAATAT ATGTGGAGAT TTGTTGTCTT GTGGGTTAAA AACATGTTAG TTGGTATTTG 1320
TGATTGTTGA TGAATCATTT TTATGAGTTT GATCACTTTA ATGAATCGAT TCACCACATC 1380
CTTCACAAAT TAGTCGATTG TCCTGTTTGA ATCTTGGTGA TTTGAGATCA AATAAAATAA 1440
CTGTATTCTA GAAACAGTGA TGGGTAAAAC ATATACATGT ATTAGGAATC TTAAGCCTAG 1500
CTTCTTTATC TAATGTAGAA GTATGTCTTG TGTTTATTTT GATTTCCACT ACATTTGTGA 1560
GTCATCATGA CATGCAAAAC GGCTCTCGAA CTTACTATTA TAGTTAATGA GCAAATACTC 1620
CATGAATATC AACTTTTCAT TCGCTGTTTT ATGGAATAAA AACATGTTTT TTGATATTTA 1680
AAATTGTTAA TGAATAGTTT TTATGAGTT 1709