EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03996 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:44120136-44121397 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr11:44120205-44120215TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr11:44120205-44120215TCTAATTAAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr11:44121278-44121289GTTTTAATTAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr11:44121281-44121292TTAATTAAAAC-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr11:44121159-44121172ATTAAGTGTTTTT-6.42
POU1F1MA0784.1chr11:44120251-44120265AATATGCAAATGAG+7.82
POU2F1MA0785.1chr11:44120251-44120263AATATGCAAATG+6.74
POU2F2MA0507.1chr11:44120252-44120265ATATGCAAATGAG-7.52
POU3F1MA0786.1chr11:44120252-44120264ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr11:44120252-44120264ATATGCAAATGA+6.37
POU3F3MA0788.1chr11:44120251-44120264AATATGCAAATGA+6.02
POU5F1MA1115.1chr11:44120252-44120263ATATGCAAATG+6.32
Pou2f3MA0627.1chr11:44120250-44120266TAATATGCAAATGAGT+6.45
Enhancer Sequence
ACAGATAGAC GGACACACAG ACAGACAGAC GGATGGATGG ATGGATCTAA TGATCATTAC 60
ACACAGAGTT CTAATTAAAA TAAATTCTAT ATTAATTTTA GTAATTTAAT TGAATAATAT 120
GCAAATGAGT GTCTGATTTC TGTTATTCAG CGGATTTATT ATATAAGAGA CTTGCTCTTA 180
TAGAGGCAGC CCTGTAATAG TTTTAAATAT TCTGTTCTAT TTAATGTTTA AGTTTTTTTT 240
ACGTATAAAT GTGCGCAGAT CTCTTCCAGG ATATTTGATG AAAAACAAGA CAAGGACACA 300
CATCATCTAA TGCATTCATT TATAGTTCTA GCGAGATTCT TTCTACTCGA ATGTACATTT 360
AATGACGCTC ACCACTATCA TAAATATCCC CAATACTGAA TAATCCCTAT ACTGTGATGA 420
TAACCCCTGC ATTCCCGCTG TATTCCCTCA TATTCCCTGT TTTCTGCACC TTCCGTCAAA 480
ACATCTTTAA GGTGTCTTTA AAGCATCCCT GGCGCATGCT CCCCTCCCAC CCAATCAGCG 540
CCGCCTCCAG CCTGTCAGTT AGAAGCAGCG ACCAATCGGA GCGCAGCGTG ACGTTAGAGC 600
TGCAGTGAGC GAGTTGATAG GCGGCTGTCT CCGATCATCT CTCTCATCTT CTGATCATCG 660
ATCTCCACAC GCGCTGATTG ATTGATTATT GATTGATTGG TCGGTGATGT CGGTGCTGGA 720
GGAGTACGAG CGGGCGCCCA AGCGGCTGAA GGTGTGCTCT GAGGAGCTGG AGGACGGAGA 780
GGAGTCCGAC TCAGCATCCG CCGAGGAGGA GCAGCGCTGG AGCTCCGCAG CCGAGAGGAA 840
GGTCAGTCCG GCGGGCAGCC TGCGCACACA GCCCCGCGCC ACACTCTCTG GAGGAAACAT 900
GACGCTCTTA TTGACACGTT TAGAGTCCAA ATATATGAAC ATTCCTCAAT CATCAAGCAT 960
TTTATAGACT AGAGGGAAAT ATTGTGTTGT TTTCAGAAAT AATAATTACA TTTAATAGTC 1020
AAAATTAAGT GTTTTTCCTT TAAAATGAGT TCAGTAATCT GCCAGTGGGG TGAGAGACCT 1080
AATGTTGTTT TCGTTTTGAT GTCACATTAT TCTGCACACC TCACTGGCTG ATTATTTAGC 1140
TTGTTTTAAT TAAAACTCAC ATATTTTTGA CTCATTATTT GTGAAAACAG CACATTATTG 1200
GTCCACAGCA TCACTCCACA CTCAAATATA CAAACACTCC TAAATCAAAA CACAAATATT 1260
T 1261