EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03993 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:44077558-44078775 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NRF1MA0506.1chr11:44078323-44078334GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr11:44078322-44078333CGCGCATGCGC-6.02
PBX3MA1114.1chr11:44078347-44078364ATCTGAGTGACAGATGC+6.17
Enhancer Sequence
GACTGGTACC TTTCTAAGCG GTTGTAGGTG TTCTTCTGAA GTAAATAGTT CTGGTTTGTC 60
GTGTTTTTGT CGTCCATGTC TGCGTGTTTG TTCGCCTCTG TCGTGTTCCG TTATTATCAC 120
ATACCCGCTC AAAGTCTGGA CTGCAGTGCA AAAGCGCGCC AGTGGGGCGG AAGTTGGTCG 180
TCATTTATGA GAGGGCGGGG CAAGAAAAGC CCGTCAGATT CACTCAGAAT AAAGATTACA 240
GGCGCTCTGA TTATTGAATT ATTTTAGGAC CTAATTAGTT CAGACAGCTG CAATGTAAAA 300
AGACAGTATT AATTTTAATT TATAACAGTA ATAATCTAAA CCCAGAGGCT TTCCCGTCGA 360
GTTGAACAGT AAATCTGTGC GGGTTTATTA GTGTCATCAT CAGCCACAGG TTAAATCAGA 420
AATATTCTGT TTTTGTGACC AGTTTTCTGA GCTTTCATCA CTTACTATCC GAAAATAAGT 480
TCATAAAGTA AAAAAAGCAC AGCTTATCAG CAGTTCCTGC ATGAAATGAT GTTGTTTAAA 540
TTAACATTCT CTCAAATAAA TATAGCTTAA TCATAATAAT ATGAATAACA ACATTATGCG 600
ACGCTAATAA AATATAAACT GGTGCACTGG ATGATGTTTA TTTTTAGGAA AAGATTTACT 660
GTTCCGGAAT TCGCTTTCAA TGCACTGCGT TTGAGACTGA GTGAGAACAG CTGTGCTTCC 720
TGCAGTCACC GGCAGAGGGA GCCACATTAC TGCTGCGGGC CTGACGCGCA TGCGCGGTGT 780
GTGAAAGCCA TCTGAGTGAC AGATGCTGGT GTTCTCCATC TGCTGAACAC AGGGAAGCGG 840
GGTGTTTGCT GATTATTGCT CTAATGATCT GCTAAACACA CCGACACTGC GCTGATCTGC 900
AGTCAGTCTG GCTGAAATGA CTCACCTGTG CTCGCTCTAT CTGTGTAATG ATGAAGAGCT 960
CCGCTAGACG GCGCGTACAT CTCTTCACGT GACACTCACC TGCTCTGCTC CTGGCGGGAA 1020
ACTCTAAGGT AAACAGCTAA TGTTTGTCGA ATATTGTTGC TGATCAAAGG TCTCTGTGCT 1080
GGAAGCTCTG TCTGTGAACA CTTATAAGCA GACTTTACTG CACTAGACAC ACACTCCTCC 1140
TGTGTTCTGG AGGATCCCTA ACATGAATCC AGCACATACT CTCAGTACAC ACTGTGAGGA 1200
GACCTGTACC TCCGCCA 1217