EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03964 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:43408769-43410014 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr11:43409609-43409626TTATTTGTTTATTTTTT+6.38
HOXC12MA0906.1chr11:43409294-43409305AGTCGTAAAAA-6.02
HOXD11MA0908.1chr11:43409295-43409305GTCGTAAAAA-6.02
HOXD12MA0873.1chr11:43409294-43409305AGTCGTAAAAA-6.62
YY1MA0095.2chr11:43409780-43409792CAAAATGGCTGC-6.52
Enhancer Sequence
TTCCATAAGC AGGATTGCGG TCACTGCTCT GGCGTTATTG ATGCTGTATG CAAAATAATC 60
CCCAAATAAT TACGACTCGC TTTGAAACAA CGTTAAATAA TAAATGCTAA AATAGTAAGT 120
GATAAAAAAT AGGAAACACA TGAATATAGA GGACACATAA TTAAATATTT AATCAATCAT 180
AAGTTAACTG GGCGTTCCTG ACCAAATCAT ATTGGCAGAT TCACTGAAGC CAACACAAAA 240
TACTAGTCAA TATTTATAGA TCAAAACCAT TCATCAAAAC TGTCCTAAAT CTAAACTGTT 300
TAATACAACA ATGCTAATAT TACGTTTATA ATAGGCTTAA TTATAATTTA TCATTCATAA 360
TAAAATAATT TGTAATTAAT GATTACACGA TAACAATATT GTGAACCCTC TACTGTACAT 420
TTCCACTGAC AAAGATATTA AAATGCGATG TAAACACAAT AGAGAAGTTG TTTTTCGGCT 480
GCTGGGGATT GTGAATTACA CAATACAGTC GCACTTATTA ATTAAAGTCG TAAAAAAATC 540
AAAAACAGAC TGTAAAACAG GCGTCGTGGG GACGAACGCG AATGAATGGC GAATGGCAGA 600
ATCACTGCGC CACATAGAAA TGTTCCCAAA ATGAACGCAA TGGAAATAAT GTGCGGTTTT 660
ACCTGTCAAT CCGAAGGGAT TTGCTGTCTC TGTTGTATTC CTTTGCTCCA GTGACACGAT 720
CCTAAATAGG ATAAATCCGT TTCCAAATCC ACCGCGACAC AAGCGAGCTC AATAATATCC 780
TCATCAGAAT AAAAACGCGC GCGTCTCGTC TGAGGCTGCA CTTCTCTTCA GGTTTGTTAG 840
TTATTTGTTT ATTTTTTGAC ACGGGTGCGG GTTGTGTTGG TTGTTTTTTT TTGGTGGAAA 900
AATCGCGGAC GGAGAAGGAC GAGGACGGAA CGCCGCACGA ATATAAATAC CGCTTATTGG 960
AGGCTTAATA TATTCAGCTG TGTGAAGCGG AGGAGTGTGA GGGAGCGCTG CCAAAATGGC 1020
TGCCCCCTTG GCTACTTTTC AGAGCAAAAG TCTGGCAGGT GGTTGAGTTA TACAAAATAA 1080
AAGACTCGAT ACTTCTCATT ACGTTTTTTT TTTCTTGTAC TGATTATGAG AATAAAAAAT 1140
TAGATACATT TAAAAAATGA TAATAGTATT TAATTATGGT TGATTGTTTT TGCTTTATTC 1200
ATATAAAATC ATATATGGAG GACGAAACAT ATTCCTGTAT AAATA 1245