EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03961 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:43334093-43335194 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr11:43335178-43335189TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr11:43335177-43335190TTGATTAAATTAT-6.98
Foxd3MA0041.1chr11:43335102-43335114AAATGTTTGTTT+6.27
Hoxa11MA0911.1chr11:43334346-43334358GATCGTAAAATT+6.27
IRF1MA0050.2chr11:43335041-43335062TTACTGTTTTATTTTCATTTT+6.01
PBX2MA1113.1chr11:43334658-43334670GTGATTGACAGG+7.22
PROP1MA0715.1chr11:43335173-43335184TAATTTGATTA-6.02
SRFMA0083.3chr11:43334357-43334373TGTCCATATATGGCGT+6.09
SRFMA0083.3chr11:43334357-43334373TGTCCATATATGGCGT-6.2
Enhancer Sequence
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNACTCCA CACAGAAATG GCCCAGCCAG AACTCGAACC 60
AGCGACCTTC TTGCTGTGAG GCAACAGTAC TAACCAATCA CCATATCGCC CTTGATAACG 120
AATAAATTAA CAAATTAATT ACTCGTTCAA CAAACACAAT GTAGCTACAA TTTGAATTGT 180
AAGCAATTGT GAATCAAAGT AAATGTGCAT CAAGCTGAAT AACTTTGTTT AAATGTATAT 240
GAATAATAAA AACGATCGTA AAATTGTCCA TATATGGCGT GATGGCGTCA CATCCTCGTG 300
ATTTGAATAT CCTGTGGGCG GGGCGGTGAG GCTGTACGGG AGTAGTGGAG CAGATCCCGG 360
GTGACAGAAT TATGTTTTAA CCGTTTACAT GCGCGATTAA AGTCTCAAGC TCTTCACAGA 420
TCAAACTACA GGTGAGTGGT GTTTCACAGA CAATGCGGGT TTGCTCAGTT TGCGAGTGTT 480
TTAGTCAGTT TGGGCAGGCG AGAACTCTAG TTTTGAGGTA TTTCCTCGGG TTGAGGCGCC 540
ACTGTGCCTT TGTGGGAAAA CTTTTGTGAT TGACAGGTTT GTCATCCAAT GAGAGTGCGA 600
GTAGAGTAGC GTCCGCCTGT TATGTTGTCG TTTGAGCTAA TCAGGAGTTA GAGAAGGCGG 660
GCTCTTGCGG ATAACAATGA GGAAGGGGTG GTGTCCGCGG ACTGGAAAAG TAAAAATCGC 720
TTTAATCTGT TTAAAAACAG GTTGCTTAAA AGGTTTAATG TGTTTTTTGG TGGTATTTAT 780
TGTTTTCTGT TGCTAACCTG TGTTTATGAG GTTTGTTCAA ACAAGAACTT TGGCTGTAAA 840
AGTGCAGTGG TACGATTACT GTGTACCATA ATAGTGAATG ATTACCAAAT TCAAATACAG 900
CACCATGGTA ATATTGTGGT GCTATAATAC AAGACCATGT AGAGTATGTT ACTGTTTTAT 960
TTTCATTTTT TCCAGTCTCA TATATTAAAA ACGCCCAAAA TACACTATTA AATGTTTGTT 1020
TATCTCCCAA AGTGGGTAAC AATGACAGGG GGGTCGCTTG AGGATTTCCA AAAGTCAAAT 1080
TAATTTGATT AAATTATAAG A 1101