EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03871 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:40143078-40144157 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX2MA0890.1chr11:40143504-40143514ACCAATTAGC+6.02
LMX1BMA0703.2chr11:40143089-40143100TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr11:40143086-40143097ATTTTAATTAA+6.62
Enhancer Sequence
AAAATAATAT TTTAATTAAA TTCGGGTGGG TGGCGGGCGG TTGTACTGTT TTTATATTCA 60
TAGCTGGCGC ACCAACGAAA AAGCCTAGGA CTGACTTCAC AGAATGGGAG GAGGAATCGG 120
ATACATTAAT TCTGGATGAA GTGTACAGAA GTATTCCTCT ACAAACTTCT GTATAGACGG 180
ATCAGCAGAG GAAAATCTAC TTTCCTTTTG GGAAAAATAA GGCCAGGCAT TCCCATGACT 240
ACAGCACCTT TCCAAGAGAA TTCTATGCAT TTCAGCAACA AGTGCTGCGA GCGAGCGCTC 300
CTTCAGTGCA GCAGGGCGCA GTGGCTATGC AGGCGCTCCC GTCTGAATCC TGACACTGTA 360
GATGCTATTT TATTCCTGCA TTGTGCCAAG AAAAAATCAA ACTAGACCTA AGGTCAGGCA 420
TATTAAACCA ATTAGCCTAT GTTATTTAGG CTACACATAT GTTCAATATA AACTTTTGAG 480
TTCGGTCAGC TGATAATTTT ACGTTCATAT TGGTTTAGCC TATTCTATTC TAGACATGTT 540
GGCCTCGCTT TTACGTTCCG AGGCTAAGGT TATTTTGCCA GAATTTCTTT GTCGCAAATT 600
TAATGGCGTA GTATTTCGTT ATGCTTCAAG TTTGAGGGCA ATGGGGATGA TCCTAAGTCC 660
GTGGGTTATT GGGGCACTTG TCATACATGC ACTTTAGCCT GGTCAGGTTC GCTCAAAGAG 720
GGATGGCATA TCTATTTTTC TAATTTAATT TCTAATTGTG GGGGTGACTG AGCCTACAAG 780
GCTTAGGCAC GATATGACGT TTTTATGAAA AATTTTTCAA CTGTTTGCCA AAGCATGCGA 840
CAATAGAATA TGCCTACATT AAGATATTTA TGTTAATATT TTTTTTACTG CCTGTTGTTT 900
CTTCTGGCAT ATAAAATAGG TATTGTCTGA CAGAGATATC AATAAAGGTT CATCTGTGTC 960
GCAGAACTGT GTTGATTCCG ATTTCTACAA GCTCAATAAC ATCCACAGCA AAAAATAAAA 1020
AATAGTCGAA AAACTGTGCC CATTAATTAG ATGTGGAAGG CAAGCAGGTA CGTTTTGAT 1079