EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03549 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:27559073-27559966 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr11:27559700-27559713TTTAAGTGTTTTA-6.33
RFX1MA0509.2chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA+6.09
RFX1MA0509.2chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA-6.1
RFX2MA0600.2chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA-6.03
RFX2MA0600.2chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA+6.11
RFX3MA0798.1chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA+6.06
RFX4MA0799.1chr11:27559608-27559624TGTAACTATGGTAACA+6.23
Enhancer Sequence
AGAACTTCTC AAATAATAAA TATTTTCATA GAAAATATTT TTTAATAGAT TTTTTTTTTA 60
CTGCTAACAA TGAAAATAAA GGCATTGTAT AATAATAATA ATGCAAATAA ATACAAATGT 120
GTTTATCCAA TAGATTAATA CATAAATAAA CACACTGTGT TATGTAGAAT TAGTTCTACA 180
CAATTTAAAG TAACCTTGAT TTAAATTAAT TGTGTAAAAT CTGCCTTTTT AACCATGTAC 240
AACTAACCCA TGTGTTACAA CTTGCCAGAC AGGTGGGGTA AACAGTAACA TTTTTACTCT 300
ACTATTTTTA CTATATTGTT TAGTCCCTGC TCTCCACACA CTATTTACTC ACCCTCAAGT 360
GTTTCCTTCA TGGGGTTCTT TCGTCTGAAG AGAAAACAAG ACATTTTGAT AAAACAATTG 420
CTATCCGTTG TGAAATATCG ACCAACCGCC ACTTCTACAA ACCAACAAAA AAATTATCTG 480
AGCTGCACAG CTTAAAGTAT TCCATTGGAA CGCGTTCTAA ATGACGATCA TCTACTGTAA 540
CTATGGTAAC AAGACACCGC AAACGCCACA AAATTGAGTG CAAATATTGT TACATGTACG 600
AAGCCATATT AACGGAATAA AAGCGGGTTT AAGTGTTTTA AAGCACGTTA ATTATAATTT 660
GATAACTTGA GCCTATCCCT CTGCCCCTGA GTGCAACTGT CCTACAGATT TCCGCTTCAA 720
TTTGACGTGG AAATATGATT AAGATCTGAA TTAGGTGTTT AATAGGATCG GCCATGGCCA 780
CCCCTGTATA ACTCTGGTCA ATATGATTTT GCTGTTGATA TTATATTTTA AATGTACTTA 840
TGTAAATTCG CAATATTTCA ATGAATAAAT AAAACAAATA AATAAATAAA TAA 893