EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03314 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:16259893-16261355 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
HOXB13MA0901.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
HOXD13MA0909.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
SOX13MA1120.1chr11:16260033-16260044AGCCATTGTTT-6.14
YY1MA0095.2chr11:16260328-16260340GCCGCCATTTTG-6.92
Enhancer Sequence
CTTACAACCA ATACCTTGTT ATGATTTTAT TGGGCAGAAA ATCCTCTGTC AGTACTTCAA 60
GGTAATTTTA AACGTCTTAT ATTATTTATG AGACAATTTT AGAATTGGCA TTTTTGTCGT 120
TTGATATTCT ATGACTTACG AGCCATTGTT TCGTCAAATG ACAACTTTAG CTTGGTGTTT 180
AGTAATTGAA AGCGTGTTGT TTAGGTGTTT AACAAGGCAT TTGGTTCGGA CTGGACAGTT 240
TTGTGTACTT ACAGATGCAC AGTGCTCTTT GGCAAGTCTT GAGGGACATC AGTCATGTCC 300
AAACGACTGC AGTCGGTCGT ATCAAGCGTA CACGTACAGT TTTGAGGACA CGGTGCGCCA 360
TAATTGATTA ACAGTTCCAG CGTCAAAAGC CAATAAAACA CATGATATGA AAGTGATCCC 420
ATCTGTCCCA GCCACGCCGC CATTTTGTAT CCAGTTGTCT CAGCGCTTAA CGACTGATCT 480
CTCTCATCCA CAAACGGACA GCTCGAGCTT ATTGAGTTTC TCAGAGTTCG AGTAATTCGC 540
CTTCATTAAG TTGTTTGTTT ACCCAGCGGT ACTATCAAAT TATACTGCGT TGCTTTCGGG 600
CAATGCATCT GCCCTGAACT TGAAAACAGT CCCACAGTTT GAAAAAAAAT CTCCTCTGCA 660
GCACCACGTA AGTAAATCAA AGGTGAATCA CGACGAGGCA ATACAAGAAA CTTGTCCAGT 720
AGCCAAAACT AAATGCAGTT GTCCTTAAAA GGTTGAAAAG GGGGTCTGTA TGGGGGATAG 780
ACGGGCGCTT TGTTTTGGCA AGAGCGATCC ACTGAATCAA ATGTAGTTTG AGGAGTTTAA 840
ATTGTCCACG GTGTTTCTGA ACTTCTTATA ATGTTTTGAT CCTAAGGGAT TCATTATAAC 900
GAAGAGTAAA CACATAGTAG ATCGTGTCCA TTAACTCCAC ACGAGCGCGT TGAAGGAAAA 960
TCTAGGATCA TCGGCGCTTT AAAGAAACTT TTCCACAGGG AAAACCGCAC TCTTTAAAAA 1020
GTTTGAGGCT CTCGTTTCTT CTTACAAAGT ATCCAAACTG CGACTCCACG ATCAGTCAAG 1080
TAAAAACAAT AAAACAGTTT TGAAGAGAAA CAGTTCCAGT AAAGCCGTCC GACTGTTGTG 1140
AACTTTGCGG CTCTCTCGTT CGTTCGTACA CTCTCTCCTT CCAGCGCGCG GTTGAAGGAA 1200
TTGGGAAGCT TTTATCTTGA TCTCGTTGTA CGGTCCGAAA ACTCTGATAA TTTACAAATT 1260
CACCTCGCAC TTCTAACCGT TTCCACCGCT TGTTTTCCCC CTCCCGGACT TTACTTTCTT 1320
TTTATCCAGA CGTTCCTTCG TCCCACGTTG GATACATCAG AAGTGATAAA GATTCCCTCG 1380
TTCTGCTTTA CAATTGGCTC TTGGGGCATG ATTGACGGCC AGGCTCTGGC TCTCATTGGC 1440
TGCTTTGGAG CGCTCAGGCG CT 1462