EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03184 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:12405478-12407356 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr11:12407283-12407296GTTTAATTAATTT-6.28
Lhx3MA0135.1chr11:12407283-12407296GTTTAATTAATTT-6.28
PHOX2AMA0713.1chr11:12407137-12407148TAATTCAATTA+6.14
PHOX2AMA0713.1chr11:12407137-12407148TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr11:12407137-12407148TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr11:12407137-12407148TAATTCAATTA+6.14
Enhancer Sequence
CAGCTCTCGC CGGGTTCAGT GGCGCGTGCC TGTAATCCAA CCCAGCAAAC ATTTGGACGT 60
CCGATTACCG CTGAAAAGAC GTCGCTCCGT CACGTGTCGT CCTGGTTGAA AAGTAGTGCC 120
AAAATGAAAA TCCAACCGAC GTCTTTTACG TCTTCTGGCC GTGAATCGCA CGTCTTTTCT 180
ACACGGTCCC TGCACGTCGA AATATGTCAT GTTCTGGACG TTTTCTGGTT GCTTTTAAAA 240
CGTGTTATTT CTTTATAATA AGTGTTTTAA TAGCCTAATT ATACATATAA AATAATCAAA 300
CTTATTATTT AAAGCTGTGA AATGCAATCA GGTCCAATTT CAGTCCAGTT ATACCTAAAC 360
GTCTTTATAG CATTGTAATC ACGTGTAAAC CATAAGTAAT ACATTATTTA AGGATGCAAT 420
AGTGTTACGA TTAAGCAAAT TATTTATTGT GCATATAGTA ACAGATGTAC ATCACTGTTA 480
AACAGACACA TCTAATAAGA ATAAATAAAA CAACAACACA GAAATATGGA CAACACAAGT 540
GAAATGTTAT TTTAGAGTCT TTATTTCTAC TATTCTCCAG CTCTTCCTGG AAGGTGCTTG 600
CTGTGTTCCT CCATTGCTGC ATCTTTTTCT GTGTCTGTAG CATCTGGACT CACTTCACAG 660
CATCTGAGGA AGGAGAATAT GATTTTGTAT CATCTTAAAA CTAAAAACTT ACAACATATC 720
AAGAATTACT GTCATGTTTC ATGAATGAAC AGCAATGTGC AGAGCAGTAT CTAATGTCAA 780
TACATACATA TTCCCTACTA CTCATCATTT TACAACTGCC CATATCCACA CATCCACAGT 840
TTTGTGACAA GCAAAGACTG TCATTCATGG CTTACACTAA AATTATCATT TAATATTTTC 900
AGTCTGCTTG ACAGCCTGAG TCTGTACAAA CATTTTAAAA CATCTGAACA TTAAAACAGG 960
CATGTCTATA AGGAGACGTA CAATGATGAA TGACAGATGA AATCTACAGT TTTAATTATA 1020
TAAAATGCTG GGTTAATTGT TGGGGTAGTA AAATATATTT TCCTGAAATA TTGTGCAGAA 1080
ATAAACACAA ACAATGCAAG ATAAATATGT ACCCGTTTAT CACTCTTTTA ATCAGGCTCG 1140
GACAGAACAT CCACCAACTC CGGACAGTTG CTGAACCTAA ATGTGACACC AAAATCACAG 1200
TCAGAGCGAT CCAGACAGAC AGAGACACAC ATTCTGTCAC ATTTAAAACT TACACAGATC 1260
CAGTTCTTCT TTTTAACTTT GATAAACACT TCACAGGATC TCGCTCTCAG AATCCAGTCT 1320
CTTAACAGAA CATGTAGACC TGCTGCAGTC CACAATGACA ATTACTGTAA CAGAGCAGCA 1380
GCTAACATCA GGCTCATGAT GACGTTAACT TTTCTAGTTG CAATTATTTA CTAAAGCGTT 1440
TATCAGAATA TGCAATAAGA TCACAATACT CACCATAGGT ATAAAACTAG CTCTAGGTTT 1500
GCAAATGTGA ACTCATACAC ATTATACACC TAAATAAACT TTTAAGCATT CAACAAGTTT 1560
CTCACCTACT CTGGAGTGTC CTCAGGGAGT GTGATGACAG AGGATCATTT GCACTGGAGA 1620
CAATTCTACA GACAAACAAA ACAACAGTGA GAAAGGTAAT AATTCAATTA TTTAATGAAC 1680
AGAAAATAAA TAAATGCAAA GCCTTATATG ATTCTTACAG TCGGCCTGGA GAAAGAGTCT 1740
TGAATTCTCT CTGACAGATG ACTGATTGTT ATTGACCCTG CAAGACAAAT TTGAACCTTA 1800
ATGCAGTTTA ATTAATTTAC AGTACAAAAA CTATTTTACA GGAGCAGTTA AAAGAAAAGT 1860
GGTTAGACTT TACCTGTT 1878