EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03071 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:9627432-9628146 
TF binding sites/motifs
Number: 30             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG-6.26
ATF2MA1465.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG+6.38
ATF3MA0605.2chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+7.22
ATF3MA0605.2chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-7.22
ATF7MA0834.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG+7.82
ATF7MA0834.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG-8.12
BATF3MA0835.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG-7.95
BATF3MA0835.1chr11:9628020-9628034TGATGACGTCATCG+8.12
CREB1MA0018.3chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+6.44
CREB1MA0018.3chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-6.44
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+6.52
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-6.52
Creb5MA0840.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+6.62
Creb5MA0840.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-6.62
GRHL1MA0647.1chr11:9627496-9627508TAAACCGGTTTA+6.22
GRHL1MA0647.1chr11:9627496-9627508TAAACCGGTTTA-6.22
JDP2(var.2)MA0656.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+7.22
JDP2(var.2)MA0656.1chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-7.22
JUNB(var.2)MA1140.2chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC+7.22
JUNB(var.2)MA1140.2chr11:9628021-9628033GATGACGTCATC-7.22
JUND(var.2)MA0492.1chr11:9628018-9628033GTTGATGACGTCATC+6.42
Lhx3MA0135.1chr11:9627744-9627757TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr11:9627741-9627754GATTAATTAATTA-7.34
POU6F1MA0628.1chr11:9627742-9627752ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:9627746-9627756ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:9627742-9627752ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:9627746-9627756ATTAATTAAT-6.02
TFCP2MA0145.3chr11:9627497-9627507AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr11:9627497-9627507AAACCGGTTT-6.02
TP63MA0525.2chr11:9627716-9627734ATCATGTCACAACATGAT-6.04
Enhancer Sequence
CTCTGTAATA CCGATCTGGC GTCAGCTATG ACTAATAATA GTATAGATGA CCACAAGTTG 60
AAAATAAACC GGTTTAGGGG CCCATTCGCA CTTGTTAGTC CACTTTAATG CTAGACGTTA 120
CCACTTTAGC TAAAAAGATT GCTAAGACTC ATTTTACTGA CTCGAATCTT TGAATCACGT 180
TCAGCAAACT GAACAAATCT TTTCACCAAA ATATAATTAA GGTTAACGTT ACATGTTTGA 240
ATTAGATCTG CAGTGCCGTC ATCCCCGATG TTTAAAAACG TCCAATCATG TCACAACATG 300
ATAAAAACTG ATTAATTAAT TAATAATTAC TCCAGTAATG GCAGCAGTAA TGTTATAGCT 360
GGGCTAAGTT ACCAGCTGTG CTAACTGAAC GCCCAGATGT TACACTTGAA TAACAACTTT 420
GAACGCACAA TTTCTAACAC ACGACTCATG TAACGTGATG AAGAAACACA AAATTTATTA 480
AAATGCAGTT AACGCCGTGA TCTCATCACA AAAAGAGGGG AAAAGCCCTT ACTTACTTGA 540
TTCAATGTCG ATGCTCATCA GGTGAACTGG CGTTGAACCG AGTCTCGTTG ATGACGTCAT 600
CGCCGTTAAA GTTGGTGCGT GGCATATGGA CGCATCTGTT CTCCAAAGAA ATGAATGGGA 660
AGGACTGGCG TATCATATGC ACGCAAAAAC GGATTTTGGC GTATGCATTG CACG 714