EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03039 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:8225794-8228501 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr11:8226429-8226443AGTAGCAATATTAG-6.49
Arid5aMA0602.1chr11:8227709-8227723ATTATCAATATTGG-6.51
BHLHE23MA0817.1chr11:8228005-8228017AAACATATGCTG+6.04
Foxd3MA0041.1chr11:8228146-8228158GTTTGTTTGTTT+6.32
GBX1MA0889.1chr11:8227231-8227241ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr11:8227231-8227241ACTAATTAGC+6.02
IKZF1MA1508.1chr11:8227573-8227585TCTTCCTGTTTT-6.07
LHX6MA0658.1chr11:8227231-8227241ACTAATTAGC+6.02
PBX2MA1113.1chr11:8226835-8226847GTGATTGACAGC+6.92
POU4F1MA0790.1chr11:8228121-8228135ATGAATATTTAATG+7.06
POU4F2MA0683.1chr11:8228121-8228137ATGAATATTTAATGGG+7.16
POU4F3MA0791.1chr11:8228121-8228137ATGAATATTTAATGGG+6.84
SPICMA0687.1chr11:8227572-8227586TTCTTCCTGTTTTT-6.37
ZNF24MA1124.1chr11:8228087-8228100AAATGAATGAATA-6.42
ZNF24MA1124.1chr11:8228083-8228096GAATAAATGAATG-6.5
Enhancer Sequence
GAATCATATC AATCTAAAAT TATAAATTCC AAATAGACAT TCGAGTCATT TAAAGAAATT 60
GTATTAATAT AATTACAATA CAATACAAAA ATATGGCAAT TTTGAAATAT CGTACAGCCC 120
TAAATGGCAT TACACATTTA AATGACAATT GAACAACGGG TCTTATCAAT GTTTTAAAGT 180
AGAATGCCCT TAAATAGTGT AGCATACAGG GCTCGAAATT AACCTTTCTG CTTGGTTGCA 240
CTGGTGCTCC TAACTTAAAA AATTTAGGCG CATCAGCCAA AATTTAGTCG CACTTATAAG 300
CACCGTTACT ACAAGTTTTA TACAAACATA TTTATTGCAT TTAAAATCAC CACTAATCAA 360
ACTAACAAGC AAAACAATAT ATATGCATGC ATGAGAAAAA TATGTCTCAA CGAAATCTCG 420
TTATCACAAG AAAATAGATT TTTTTAACAT AACTGAGTGA CCAAAAGGTA CACGGAGCGC 480
TCACCGGCCC TTCATGCACT GCTTGACATG AATGAATCTG TTAACGGTGT AACTGTGCTG 540
TTCTCACGTG TCGTGTCTAA TATTGCACTG ATGCTTTTGA CATATACTGT ACCTTATTAT 600
ATGCATACGT CATGTTAATA GCAATACTTT TCATGAGTAG CAATATTAGT TTACTCAGTG 660
TAAGCCCATT TGCGATGGTG TACGTGGTGT TCAATTTTAC ATATAGCTGC CCCTTGCATG 720
GCGGACAGAA TCTGGCGATT AGGATTAAAC AGAAGCTCTC GTGCTAGATG TGGCACAGAG 780
TTACCTGAAA ATTCCATCCC ACAGACTTTT TATAGCGGAC TTGAAGCCAA TTTAAGTAAT 840
TTATCCACTC ATCGAAAAGT GTAGACAGTG GATTAACATT CAGCACATGA TCACTACTAA 900
GATGTGTCAT TATTTGTAAC TTTAGATGCC ATGGTTTCTA AAACAAAATC TGTCAGTGTC 960
ATCTTTATTC TCATCTTCAG CGCTTTAGTT TTTTGCGGTA GTAGCTCTCT CTGTCATCCC 1020
AAACCAGAAG GCAATGACTG AGTGATTGAC AGCTGATATT TTAGTGCTAG AGCAGTGGTG 1080
AGCCAATAAG AAGAGCGCGA AGGCGGGGCA AGCATTACGG ACTTGGCTCT GTTTACTGCA 1140
GCAAGTTGAC ATGACAACTG TTTTATACCA TTCCTGAGCG CTGCGTTTCG CGTTTCAAGT 1200
GCAGAGATGC ATTCTGCGTG AATGTCTCCC AAATCTGCGC ATGTGGTGAA CATTTTGCAG 1260
TCAAAACTGG TCGCACACAA CAATTTCTTG CACTCGCACA AATGCTCCCA AATAAATTTT 1320
GAGGTCGCAT AGGTAAAATT TCAGGTGCAT ATGCGACCAA AATGGTCGCA ATTTTGAGCC 1380
CTGCAGTTTA ATAATCAGGG TCAGGGGTTT GATTACATCT CTAAACCCAT ATGCTATACT 1440
AATTAGCAAT TACCAGCTGC TTCTTCTACT GCGTCCTTCA TTTGAGAAGA CCCACAGTCT 1500
CTTTTTAACA AGTGCCACAG CTGCCTGGCC TGAACACAGG AATGGCCATA TTTGGGAGGA 1560
AGTGTCCATC AGGTCATTAC TATGTTCCTT TTGCCAGGGG AACAGTAGGA AGTGAGGTTT 1620
CCTATACCCA TAGAGAGAAC TATTTGTTGT TTGAATGGCT TCTCCAAATT GAACATTGCA 1680
TTAGATGATG CTTCGTACCT GGATGTTATC GATCTGCTGA TGTGCTGGAG CACTGATTCA 1740
GAGGCTTTTG ATGCCATTAT ATTGAATAGA GATTTTATTT CTTCCTGTTT TTATGGTCGG 1800
CCAGATGAAA ATAGTAAGGG TGATTGCTTT GAAGTGCACA AGAGCCACAG TACATCAAGC 1860
CACATGATTT GAGGTATGCT ATTTGTGATT TTAGATGGAG AATTCAAATT TACACATTAT 1920
CAATATTGGG AATAGGGGCA GCACAGTAGC TCAGTCGCAG CAAGAATGTC ACTAGTTCAA 1980
GTCCCGACTG GACCAGTTGT CATTTCTGTG TGGAGTTTCT GTGTGCATGT TCTCTCTGTG 2040
TTAACGTTGG TTTCCTTTGG GTGCTCCGGT TTCCCCCTAT AGTCCAAAGA CGGGATAACT 2100
GAATTGGATA AACAAAATTT CCCCTTAGTG TATGAGTGTG TGTGTGTGAA AGAGTGAGTG 2160
TATGGGTGTT TCTCAGTACT GTGTTGCGGC TGAAAGGTCA TTCGCTGTGT AAAACATATG 2220
CTGGAATAGT TGGTGGTTCA TTCCTCTGTG AGAACTCCTG ACAAACAAGA GACTAAGCCG 2280
TAGGAAAATG AATAAATGAA TGAATATTGG GAATTTGTTT GTAATATATG AATATTTAAT 2340
GGGTTTAATT TTGTTTGTTT GTTTTTCATT CATAAAATCA AAATTGGCTG GAATATTAGA 2400
AATGTATTTG ACTTTTCTGT TTTTATTTAG AATTGTAATA TTGTTGCATT CCTAGTTATA 2460
ATTATCATAA TTATTTATTA GTTTATCAGG TCTATTACAA GGGTTCTCGA ACTTTTCAGC 2520
CTGTGAACTC CACTATTTTC AGAAGTGGTT ATTGTAACGC TCGTGTTGGA AGGTGCATTA 2580
TTCCAAAAAA GAAACAAATC AAAATAATCA TTCATTTAAA GTTAACCTTG GGCGCCAGAC 2640
AGAAACATCT GTCAAAATAC CTTTTTGTTA AAGAAACACG CTAGCTCTTA CAACACATTA 2700
CAAATAT 2707