EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-03007 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:6625531-6627211 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr11:6626541-6626560TGTCCACAAGATGTCGCTA+6.15
Foxq1MA0040.1chr11:6626153-6626164TATTGTTTATT+6.62
Lhx3MA0135.1chr11:6626417-6626430AAATTAATTAAAT+6.07
NFYAMA0060.3chr11:6625936-6625947GGCCAATCAGA+6.02
NFYBMA0502.1chr11:6625957-6625972CCCTCAGCCAATCAG+6.05
PBX1MA0070.1chr11:6626207-6626219GCATCAATCAAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr11:6626412-6626423TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr11:6626412-6626423TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:6626412-6626423TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:6626412-6626423TAATTAAATTA-6.62
SOX21MA0866.1chr11:6625736-6625751AACAATTCCAGTGTT+7.58
Sox11MA0869.1chr11:6625736-6625751AACAATTCCAGTGTT+8.25
Sox1MA0870.1chr11:6625736-6625751AACAATTCCAGTGTT+6.89
Enhancer Sequence
GGCAGTTCTG AAGGCAAAAA GGGTGTACCT AATAAAGTGG CCGGTGAGTG TATATTAAAG 60
CACTGATCAC AATACTGTGA ATCCGAGGTA CAGTATGTTT ATCCAAGGTT ATCACACTGT 120
CAGAATCTTA TTAAATGTCC CTCTTGTGTT TTAGAGAAAA ACTGACAAAG CTGAGCTGGA 180
GCAGACCAGT TTGCTAAGTC TATACAACAA TTCCAGTGTT CTGGCTGTCC AAAGAACAGA 240
GTCCAGGCAT GTTTTATTAA CAGGAAGTGG AGGGTGGCAC AGAGTACATG CGGTTGATGC 300
ACTGCCATTC TGGAATTCTC TTGAGCTTCC CAGCATCGCC GGTCAAACAG TACAGACCAT 360
AAGTAGATCT CTCAGCCAAT CCCAGTCACA GAGCAACGGC GGCATGGCCA ATCAGACAAT 420
TTGTCCCCCT CAGCCAATCA GCTGACTTGA CCCCTAAGGT TCTGGAAAAA TATTCAAGGG 480
ATGTGAACCA ATGCTGCTGT GCTGTACACA GTGTGCTACT GGTGTGTGAA AGCAACATCA 540
GATCAATATC GAGAGTGGGT GTGTGTGTGT TTGTGTTTAT GCAGTCACAG TGATGTCACT 600
GGATCAGGGC CAAATGTTGT ATTATTGTTT ATTATAACAT TTTAACAGTA CAAAAAATAT 660
ACATGCCAGG GGGTAAGCAT CAATCAAAAT ACAAACATAC ATATGTAATA ATCAAATAAA 720
TACATTGTAG AGTTCACAAA GTTTTAAAGT GCGTAGGGCT TTCTTATTTA GAGAGTCTCT 780
GATACTACTA ATATATAAGC ATAATTCAGT CATCAACACC TTAAAGTTGG GTTTCCTATT 840
GGTAAATTTA CATATATGAC TGTAAAATTT TGTTAGCAAA ATAATTAAAT TAATTAAATA 900
AAAATATTTT TTTTATTTTT TGTTTTGGGG AGTTTTTGTT TGCATTCGAT GACATTTGCA 960
AAAACAGAAC AGATTTGATT ACTTTGTATA TGCAGGGCGG TGTTTTGTTT TGTCCACAAG 1020
ATGTCGCTAT GAGATTGTTG TATTTGTAGT ATTTTGAAGT TTCTTGTGTT GTTTGAGCCT 1080
CGATCTTGAC ATACTATAGT GTTGAAAAAT GCGCAGTGCA CCATATTTTC CTCAGTTTGT 1140
GTTATCAACA CTGATAGGTA AGACGCGTTC ATGATTGTGG GATCCTTATC TAAAATACAT 1200
CTTTGTTGTT AATGCTCAAA AGTTCTGTTT AACGAGATAT TCTGTGTACT AAACTGTTAA 1260
AGATCAAATG CAGAGTTATA TGAAGAGTAA AAGGTTGTTT TATTTTTGTT ATGAAGCGAT 1320
TAAGGAGCCG TACGTACGGT GGCCGGGAAG TGCAAAACAA CATTACAAAG TGTGAAACAG 1380
TTTTACAAGG CTCGAGACAA ATTAACATTT TGAAAAACAT TTTTACTTAT CATCAGACAT 1440
AATTACATAG GAAAAACAAT TTTACCAAGG ACAAAACAAA TTTACATTTT AGAAAAAAAT 1500
AACAATCTCC CTCGGATTGG AGTTCGGTGC GCAGTAAGAC CGCTATCTAC CAACACCACC 1560
CTGTACGTTT ACACACTGCA TAGACTGTAG GTCCACACCA TAGACTGTAA AAACAGACAC 1620
ACGTGGTATG AATTACATGT TTTAAATGAC AGCGAGACAT GCTACGTTTA GTTTTTATTG 1680