EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02862 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:573725-574904 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr11:574019-574031TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr11:574019-574030TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr11:574016-574033TTATTTGTTTACTTTTT-7.28
TFAP2AMA0003.3chr11:574667-574678CGCCTCAGGCT+6.14
TFECMA0871.2chr11:574483-574494TGTCACGTGGG-6.02
Enhancer Sequence
AATTGTTTTT ACAATAAACC TTTGGAAACA CTTGATGTTC TTTAATATTG AAACAATTAC 60
GAATACATTT GTATTATTAG AGTTGCATAT TGCATATTAT ATATAGATTT TGCACGAATT 120
CTATTGTGGA AAACAACAAT CTGGTTACAC TGTTCCTTAT CTTAAAATGT ATATATTGTT 180
CTAATGCATG ACCAACGTTA TATGTGAGAA AAATATGTTT TTAATAAATG AACTTGATGT 240
AATTAGATAA CGTCGCTAGT TTACAGTACA TGCTTTATCA ACAAATCGTG TTTATTTGTT 300
TACTTTTTAC TTACCTTGTG GAAAACCGCA GTGAACCTTG GGATCGCAAT GAACCTTGGG 360
ATAGCGAGCA TAGACTGTAA AAAATAGATC GCCACATACA ATGACCCCAA CTTTAATAAA 420
TAATTTAAAA TGAAAAATAT CAGCTGAAAA CATTTTTAAA CTTAGTACTT GAAATTTAAT 480
ATTTTTTTAA AGTAAAATAA TAAAGTAAAT AATAAATAAT ATGAATGAAT CAAAGTTTTA 540
TTAGGCATAG TTACCCTAAA CTGGACAACC GAATATATTT TCACTCATTA AATATAAAGT 600
AAATGATAAC ATATTTATAA ACACCAACTA ATCTCCAATA AAAATATATT ATGCAGCATT 660
AACGTAATAT TTAATGTTGA CAGTTGAACT CATCTGAGAA CTCACCGCTG ATGCAGTTTG 720
ACCAATAGCG GAGCGGCATT AAACTCACCG TGAAGGGATG TCACGTGGGC CGAAGTTTAT 780
TCATACAGTA GTTTCGACCC CGTTTACAGA CGCTTTTCAT GAACAAAATA AAAATTACAT 840
ATTTTTAAAA TAAGAAAACT AAGATAATAG GCGTAAATCA GGTTTTAAAA ATTGCGTTGA 900
CATCTATTGG TAATTATACG AGCCTCCAGC GTCTCCATAT GACGCCTCAG GCTCAGGCAC 960
AGATTCTATA GGGAATCCCT GCACGTCTAA ATATGACGCT AAAGGGGTAC CCTGTGCGTC 1020
AATAACTGAC GCCGAGGGTT CCTGACCAAG CGTCAGTATG TGACGAGTTG GGAGTGAGAA 1080
CGTGTTGTGT TGAAATAAAT CTTCCCTCCG TTAAACAGAA ATTGGCAGCT GCTTATGAAT 1140
GAATTTAAAT TGTTCAGGAT ATTTTTCTTA ATCTTAAAA 1179