EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02854 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:232744-233839 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr11:233487-233506CGTCCAGCAGGTGTCAGTG+6.06
IRF1MA0050.2chr11:233274-233295GATGTGAAACTGAAACTTGCT-6.12
IRF4MA1419.1chr11:233277-233292GTGAAACTGAAACTT+6.1
IRF8MA0652.1chr11:233277-233291GTGAAACTGAAACT+6.54
LMX1BMA0703.2chr11:232930-232941TTAATTAAATC-6.02
Enhancer Sequence
AATTGCTTGA CGTAATCTTT ATTTATTTTC GTGTATGTCT TTATTTCTTA TTTTGTGTAA 60
TTACCATTGT AGTTTAATAA ATCTGATAAT CAAAGACACG TGTATAATAA ACTCATTTTA 120
ATTCACATTT TTATATGTGT ACATTTTCTT AAATCAAAAA TGTAGATTTA TAATATTAAT 180
ATAGTGTTAA TTAAATCATT CTATTGTTAA TGTACAGTGA AACCGATGAG TCCATGGTGA 240
GGTAAGTTAA GTGTCGTTAT AAAGTACACT GCTGTTCCAT TTGAAGAAGT CCCCGACTTG 300
TGTCCTCGCG TCCTCGGGTG TTCGTTCTTC CAAGTCTGAT CTTCCAAGGA CGCAAGTCCG 360
AACTTTGCGT ACTCGGTATT GAGAAACAGC CAGTGTAGTC AGGTTATATT AGCTACAGTT 420
GTCCACGTAC AACTATCATT ACAGCATGTG TGATACTGCA GGCATGTAAT TGTCGTGTTT 480
TATTTGGTGT TTTGACTTTA TTGGTGATTT GTCAGGAATA TGTTTGATAT GATGTGAAAC 540
TGAAACTTGC TGTCATGTTT ATCAGACAAC ATAGTGAAGT ACAGGATGGT GTATGCTATA 600
TTATATGCTA GGATATAAAA TAATACCTTC GACAAAATGT ATTGATTTTG CTGCTTTCCT 660
CTAAGGAGAA TCAAAACACA GACACCTGAG TTAAACACAG ACACCTGAGT TAAACATGCG 720
TCATTATGAC GCAATGACGG ACGCGTCCAG CAGGTGTCAG TGTAGACTCA TGGAGCATCC 780
GCTGGAGGAG AAGATCACGT GAACAGGAGA TTTCCTCGTC AATGTTTTTA TTATCATTAT 840
TAAAGAGAAT TCTACACAAA TGGACATTTA AAACAAACCC CGTATATTTA AACACACAGT 900
GAACGAAAGA GTCCCTAAAG CAGGTCAGTC TTCAGGGCTC TACAGCAGTC CAGACAGCCT 960
TCTGGGCTTT AACACTTCCT ACATCCACCA GTGCTGTGTG TTCAGCGTGT GTGTGTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTACATTAG CGTGTATGTG TCTATGTGTG 1080
TGTTACATGT CTGTG 1095