EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02841 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr11:2133-3657 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr11:2947-2959TTTGTTTACTTT-6.62
FOXF2MA0030.1chr11:2947-2961TTTGTTTACTTTTG-6.29
FOXP2MA0593.1chr11:2947-2958TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr11:2944-2961ACATTTGTTTACTTTTG-6.83
GSX1MA0892.1chr11:2459-2469CCTAATTAAA+6.02
Hoxa11MA0911.1chr11:2644-2656GATCGTAAAAAT+6.02
SOX4MA0867.2chr11:2999-3009GAACAAAGGG+6.02
Enhancer Sequence
ACTAGGTTTT GACATGTTAA CAAATGAGCA ATTTTCAGCA TTTCAGCAGT AGGCCATTAT 60
ATGATTCAGT TATACACAAG TTTGACATTT ATGGGGCTGT GTAACGTTTG TGTGTTTTGT 120
TCCCTGATCT TTAATATATA CTGGGTAGCT ACGCAAATAT TTTCTAAAAA TGTCAAGTTG 180
ATAAATAGTG ATTTAAATCC TGATGCATTT TCACATTCAT TTATTTAACT TGCTGCGTTC 240
ATTTAATGTT TTAATACTTT TCAGCCATTA ACACAGGTGT CAAACTCAGT TCCTAAAGGG 300
CCGCAGCTCT GCAGTTTAGT TCCAACCCTA ATTAAACACA CCTGAACAAA CTAATTGAGT 360
CCTTCAGGCT GGTTTGAAAC CTACAGGTAA GTGTTGGAGC AGGGTTGGAA TTAAACTGTG 420
CAGAGCTTTG GCCCTCCAGG AATAGAGTTT GACACCCCTG GTTTGAGTTA TACTTTACCA 480
TCAAAATGTT GCATGTTATA TAATCATCAT AGATCGTAAA AATTAAAGTT GAGTGACATT 540
AGGTAAAGTG CCCGCTCACT TTTGACAAGG CCAGTCCAAA ATACATTTCT GCTATTGTAA 600
TACAAAAATG CACTATTGTT GCATTATCAT AGTTTAAATT TGTCATGTTC AGTTTATTCC 660
CCCTGCAAAC AATTTCAATT GTTACACTTG TCATTTCCCC TCCAAATAAA ATTTAGCCAG 720
AGGTGCGCAA CATGACCTCT AAAAAAAAGG TGCTGTAACA TGTACCTATA TGCAGCACCC 780
CAATATGATA GAGCGGCATA GCAGTGTTTA GACATTTGTT TACTTTTGTT TTTATTAACT 840
TGAAAGTTCA GCTATTGAGT TTTATTGAAC AAAGGGAGCT GTTTACATTA CACAACCCAT 900
CAGTAGTTGC CTTTAATGCA ATGTTTTAAA GAGCTGTTGC AGCCTGAGTG GAAAATAAAA 960
TCGTATTAGT GCTGCCTGGC CCAGTTTGGC ACAAAATGGA GCAGTTCCAT TAAGAGAACG 1020
ATTCAGCATG AGTGCAAAAG CAGCTAAAGT TTGTGAAAAT TTTTTATCTG GATGTAGAGA 1080
ATCTCATAGC ACAGAAACAG CACACCTAAA GGCATATTTA TACTTCTGCA TCAAGCACAC 1140
AAGTATGCTT CAGCACAACC TGTGCATGGT CTCATAGCCC TTGCTGTGGC AGTCAGACAC 1200
TGATGCACAC CTCAAATGAA TAGAGAAAGC TGTGATTGCT CAGATTTGTA GAGCTGACAA 1260
GTGTGCCCTA ACCTAGTCCT CATCTTCAGT CAGTAATTTG AGAGCTTTCT GACAGCAACC 1320
CGTGTAAGGC CAGATTAAGC ATCTGTAAAA CTCAATTTCT TCATCTTAAT GTTGCCAAAC 1380
TTTGACAAGC GATCAATAAC TGATGCAGAA AAGCTTATCC ATGCTTTCAT GACCTCTCGA 1440
TTAGACTACT GTAATGAGTT ACTAGGCGGT CGCCCTGCTG GCCTCACTAA CAAACTGCAG 1500
CTGGTTCAAA ATGCAGCTGC TAGA 1524