EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02529 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:34231522-34232358 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr10:34231838-34231850GTAATGGTTTTA-6.62
CTCFMA0139.1chr10:34231552-34231571CCGCCAGTAGGTGGTGGTA+6.34
EMX2MA0886.1chr10:34232088-34232098GCTAATTAGC+6.02
EMX2MA0886.1chr10:34232292-34232302GCTAATTAGC+6.02
EMX2MA0886.1chr10:34232088-34232098GCTAATTAGC-6.02
EMX2MA0886.1chr10:34232292-34232302GCTAATTAGC-6.02
FOXB1MA0845.1chr10:34232130-34232141AATGTAAATAT+6.32
Foxq1MA0040.1chr10:34232198-34232209AATAAACAATT-6.02
NOTOMA0710.1chr10:34232088-34232098GCTAATTAGC+6.02
NOTOMA0710.1chr10:34232292-34232302GCTAATTAGC+6.02
NOTOMA0710.1chr10:34232088-34232098GCTAATTAGC-6.02
NOTOMA0710.1chr10:34232292-34232302GCTAATTAGC-6.02
Enhancer Sequence
AAAATGAAGT TATCCATGTA TTACCTGAAA CCGCCAGTAG GTGGTGGTAG GACACTGTCT 60
TAAGTGAATA AGACATTTAT TCAGCAACAA AGCAACTGTT GTGTTTATGA ATAGGTCAAG 120
GATGAATCGA CTCTCACAAT TTATTTAAAT CCACAGATTC ATTCGCAAAA AATAACCCAC 180
TCTAGCCTAA CATATAAGGA CTGAACCGAT GTGAACGCTA ACAGGTAGGA ATAATGATCA 240
AATTCTTGTG GATTAAACAT CTTTGTTGAC ATCAATTGCA GTAGATTTTA TTAAGTTAAC 300
TTACAACAAA AGGTAGGTAA TGGTTTTAAT TGCGAACTGT ACTTCTTTAT TGTGTGAACA 360
TGCTACATGC TAACACCATC ACAGCTTTCC AGTCAACTAA TTTAGAGCTA CTAACGTTAG 420
TCAACAGTCC CCGCCTTTAC TAAGTGAAAA ATGCGAATTA AAAAGAAAAA ATAACATAAA 480
TAAAATAATT ACAAATTAAA CCAATGAATA TTAAAGTCAG TGTAATTAGA TCTAACGTTT 540
ATTACTGTAT GTCACAGGCT AGTAGCGCTA ATTAGCATTT GATGCTAATG CTAACATTGA 600
TGCAACTTAA TGTAAATATT AATGTTATAT TTCACTAAGT GAAAAATGCG AATTAAACAA 660
TACGTGAATA ATTGCGAATA AACAATTACA AATTAAACCA ATGAATATTA AAGTCAGTGT 720
AATTAGATCT TACGTTTATT ACTGTATGTC ACACAGGCTA GTTAGCTAGC GCTAATTAGC 780
AGTTGATGCT AATGCTAACA TTGATGCAAC TTAATGTTAC TGTAATGTAA TTAATG 836