EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02505 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:33399955-33400888 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr10:33400288-33400304CATTATTTACATAAGC-6.41
FOXB1MA0845.1chr10:33400290-33400301TTATTTACATA-6.02
HOXC12MA0906.1chr10:33400182-33400193AGTCGTAAAAA+6.02
HOXD11MA0908.1chr10:33400183-33400193GTCGTAAAAA+6.02
HOXD12MA0873.1chr10:33400182-33400193AGTCGTAAAAA+6.62
IRF1MA0050.2chr10:33400699-33400720CATCAATTTCAGTTTTTTTTT+6.02
Lhx3MA0135.1chr10:33400766-33400779GAAAAATTAATTT-6.11
Sox11MA0869.1chr10:33400700-33400715ATCAATTTCAGTTTT+6
Enhancer Sequence
TTTTTATTTA TTTATTTATT TTGCTAAATA CATCATCACT TTAAGGACAT TATCATTTAT 60
GGACAAGTAA TGTAATCATT TTTAAAAGCA CTAAGTATTT TTATTTAAGT ATTTTATTTT 120
AGAGAAATTA AACGCTTGAA ATACAATCCA ATATTATCCC TCCGCCGATT TCCACACGCA 180
TCCATCAGAA TGAAGAAATC GTAAGAGCGA GTAAAAACGT CTTAAAAAGT CGTAAAAAGT 240
TTATTTTCGG AACTGATTTC CATTGTGTAG TTGCTATTTT AATTGACGAA AGACAACACA 300
ACTGTACTTA TACGGGTAAA TCGTTGTCTA GAACATTATT TACATAAGCT TCGGCTAATT 360
GTATCCGCGT CCTAGCATAA TAAACGTTTG CTGTTTGCAT TTAAACATGT TTGAGCACAA 420
TATGAGTCAG TAAGCATTTT TTTTTGCGTG TTAGTTTTCT TGTTAAACAT TTTGTCTTCC 480
TGACTAACGT TATAGCTAAC TGCAATTAGT CAGTAAACGT CTCGCTGTAC CGGTTAATAT 540
GTTAATATGA TTCAACCATA TGGATTGTGT GTTTCAGGTG AACAAGAAAT CTTTGGTTAC 600
ATCAGCATCA TGACAGGGGT TCAGCCAATA CCCTGTCATG TACTTCTGGG CATTGTGACA 660
GGTGGAGGTT TACCAGCCCT CCTGCACAGA TACACACTTG AGAAAAAAGT ATCAAAAGTG 720
GAGAAAGTCC TCAAAAAAGG TCTACATCAA TTTCAGTTTT TTTTTTTCTC GAAAAGTATT 780
AAATGACTGG ATGTTTTCAT TGATGTTTTT TGAAAAATTA ATTTCTACAG GTGTAAAAGT 840
TGATAGCGTG AACAATCTTG GACAGACAGC ACTCTTTTGC GCATCTCTTC TTGGGTTTAC 900
CAGTGTAGCA GAGAAACTCC TGCAGTTTGG AGC 933