EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02424 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:28700766-28701871 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr10:28701303-28701316AAATTAATTATCC+6.98
NFYAMA0060.3chr10:28700804-28700815TCTGATTGGCC-6.02
Enhancer Sequence
ACTGGAGAAC TCCGTCACCT CTGACAGCAC TCTCGCCCTC TGATTGGCCA CTAGAGAACG 60
CCCACTCGAC TCCGCCCTGT TGGCTTCGCT GCTTTCTTGT TCCAGTACTG ATTTTTAACC 120
GAGCAGTGTC ACGACCATAT CATACAGCGA GAAAAGCGGG ATTGTACTGC GTTTAAGCGG 180
TTTCTGCGAG AGGATACGAA ACAGCCGCTT CTCGTTTGTG AACATCTGGG CAGAGATGTA 240
ACAGTTTCCC GGCATTGGCG TTGTGTTTTT GTTGCTTTTG TTGCAATTTG TTGTGGGGAC 300
CTCCCTAAAG CCTCAACTCA GGAACTCTGA CATTCCCTGT CTTGGCAGCT ACACTGTTTT 360
CCTTTTGCCG CAGTAAGTCT AGAGTTTATA GATGATACAT AAGAGCAATT TTCCGCATTT 420
TACAGTGATT GTAATATTTT TTTCTCTGTC TGATGAGTTG TCATAGCCTT CTAAGACCAG 480
CTGCTTCTTA TTACAACGCG TTTTGCATTA TGTTTAGTGC TTTAATATTA GTTTATTAAA 540
TTAATTATCC TCAGTTCAAT TGCAGGGCAC AAAAGCTCTA CTTTAGAGGC AGCTCAAAGT 600
ACTATGTTGA ACTGCATGCT TTTTTTTTCT GAAAAAGTTA AACAAAACAA AGTTTTATAA 660
TATTGTTGAG TTATTTACTA ATTCAAAATG GGTTTTAGAG ATTTTTTTTC AGCACAGCAA 720
TCATGAATTT TATGAGATGA GGATATTAAT ACGTTAATAT CAGACGTTTT AAATATTAAA 780
AGTACCACAT TGTAAGTTTA AAATGGCCTC AAACATATGC ATCATAACCA TACAGTTGCA 840
AAGTGCAATA ATTTCTCTTG GTGCTAATCG CTATCTTGAT ACTAATCGTT GAACTGCTAT 900
AAAAAGGTTT TCAGTTCCGC TAGTTTACAG TTCATTTGTA CTGTCACACA TCTGCACACA 960
TGTGTTTGTT GCCATCAGAA ACATTTCTGT GTGTTACAGT GTGCAGAAAA TGGCAACTGC 1020
TCTCAGTGGA CGCCCACCTA ACAATCGGAA AGGCCGTATT TTAGGCATTA TTGACGCCAT 1080
CCAGGACGCT GTCGGACCCC CAAAG 1105