EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02421 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:28637792-28638820 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX3MA1114.1chr10:28638213-28638230GCTTGAGTGACAGTCCG+6.48
ZNF24MA1124.1chr10:28638770-28638783TGATGAATGAATG-6.11
ZNF263MA0528.1chr10:28638778-28638799GAATGATGAGGAAGAGGAAGA+6.6
ZNF263MA0528.1chr10:28638781-28638802TGATGAGGAAGAGGAAGAGGG+6.97
Enhancer Sequence
GTACCTTGTT ACAAAACACA CCTAATTTTA AACAGGATTT CCTGACAGGG TTTACAGTCA 60
ACATACTCTG CTTAACTTTT ATGCTGCATT TGAGTTGATT TCATCGCACC TACTTCTAGA 120
TGGTGACACC ACCATGCTGG GAATGCTTTT CTGATCACAG ATCCACTATC TATAGAGCTT 180
CCTGGATGTT GAATATTAGT GTCACATCGG CGTCGCGCTG GTAAAATAAA GTCCAACAGT 240
GCATGTGCGT CGCCACTTAC CTGCAACAGG CCACCAAAGT GACTTAACAG GTCCGTTGTC 300
CACCTCTCGC ACCCCTTCGA TGGTGTCTTT CTCTGTTCAC TTTTTTGCAA CATACAGTCT 360
ACTGTACATG CAGTGAGTGA AAATATAGTT TTCATGTAAG GACAGTTGTG ATTGGTCACA 420
CGCTTGAGTG ACAGTCCGAG ACAGCCACTC AGAGCGCGTG AAACATCTCG GCACTGTTCC 480
GAGATAGAGA GATTAAAACC ACATCTTCAT AATGTCCAGG ACATCCACAT AACCATCAAA 540
ACATACAATA GTTACAGAAG AAGTGTGCAC TATCATTCAT TAGATCAGCA GGTGGAGTGA 600
ATTTATCGAT ATAAAGACGC CATCGAGAAA AATAGAGCGA GTGACAGCGC TTCAGAACAA 660
TCCCAACACA CACTGAACAG TCACCGAGTG CAAACACACA TTAGTGAACA ACATTGATGT 720
GTTTTCCATT ATATTAACTC TTTTATCATT CTCGATGTGG TTGAAAGACG ATATAAAGCC 780
ATACGTGTGT TTATTCGTGT CACAGACTCG TTCTCTCACA TACTGGTGCA CCGTTTTCCT 840
GTCTCGGTGC CCTCTTTATG AGAGTTTTTC ATGCGATGGC TGTGCGTGCT AACATGACAC 900
TGGACATTGC ATTTTGATAG CACAACAACT GGAATAGCAC AAGCTATGAA CGTCCAGTGT 960
TATTCATGAC GTTGGTATTG ATGAATGAAT GATGAGGAAG AGGAAGAGGG TCAACAACTC 1020
ATCATAGC 1028