EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02402 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:27419340-27420363 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr10:27419674-27419685TTAATTAATAT-6.62
CTCFMA0139.1chr10:27420262-27420281TAGCCACTAGGTGGCAGCA+8
Foxq1MA0040.1chr10:27419710-27419721TATTGTTTATT+6.62
Lhx3MA0135.1chr10:27419671-27419684TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr10:27419668-27419681AAATAATTAATTA-6.71
POU6F1MA0628.1chr10:27419673-27419683ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:27419673-27419683ATTAATTAAT-6.02
Spz1MA0111.1chr10:27419942-27419953GCTGCTACCCT-6.02
Enhancer Sequence
GCTAAACTTT CATGCGTGCT TTCTTAACAT ATCGCTATCA ATCCGCATTG AAAGCAAGAG 60
AATATAAACG TAAGAGGCGG GGCAAGGGTT TACGTTTTTC AAATTAAAAT GTTTAAACGT 120
ATATGTAGGT ACATCCGAAT AAATAAATTG TGGGAATAAT TGGGGAATTA TTCGGTAATT 180
GTGATATGGG AATTCAGAAA CGTATTGTTT TTGAGTATGT GGCATATGAA AAAGATAAAC 240
CTTGGTTAAA TCATGAATTA TAGCTCTAAA TTGATAAATA GGAAAGGTTC AAGTCATTGA 300
GATCGTTGAA GTATATTTAA AAGTTAAAAA ATAATTAATT AATATAGTAT CATATATTTA 360
TGTAGTTATT TATTGTTTAT TTTCTTAAAA ATATAGACGC ACACCGGCCA CTTTATTAGG 420
TACACCTTAT TACATAGGTG TCAGTTAATT CTTTGAGGAT AGGAGCTCTG CAGTTTTGCT 480
TCAACCCTAA TCAAACACAG CTGATCCAAA TAATTAAGGT GATCAAGATT CTATTAAACA 540
CTTCGATTTA CAATTACGAT TACGAGTTGT GTTTGATAAG GGTTGGAGCT AAACTGTGGA 600
GAGCTGCTAC CCTCTAAGCA TTTACTTTGA CACCTATGTC TTACTAGTCT TCAAAACTGC 660
CTTAATCTTT CGTGGCATAG ATTCAACAAG GTACTGGAAA TATTCCTCAG TGAATTTGAT 720
CCATATTGAC ATGATAGCTG TATGCAGTTG CTGCAGATTT TGTCGGCTGC ACATCCATGC 780
CAATCTCCCG TTCCACCACA TATATAAATT TACTTTTTTT TTTCTTTGTA ACTGCATGTG 840
AGCATTATTA TATTTAAGAT GACTCAAACA GATATTCAAT TTACAAGCCA GAATTTTAGC 900
ATTAATCACT TTAAACTCAA TTTAGCCACT AGGTGGCAGC ACAAGACCAC TTATTGTGGA 960
TTGCTGCACT TGTAGGCTTG TTTTTCATTC TTAAAGTCAC TAAAATTGAA GTGAAGACTG 1020
TTC 1023