EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-02162 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:20552185-20553245 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr10:20553181-20553192ATAATTAATAT-6.02
ONECUT1MA0679.1chr10:20552196-20552210AATAAATCAATAAT+6.36
ONECUT2MA0756.1chr10:20552196-20552210AATAAATCAATAAT+6.53
ONECUT3MA0757.1chr10:20552196-20552210AATAAATCAATAAT+6.82
RREB1MA0073.1chr10:20553214-20553234GGTGTAGGGTTGGGGTGGGG-6.17
RREB1MA0073.1chr10:20553209-20553229GGTTGGGTGTAGGGTTGGGG-6.3
ZNF384MA1125.1chr10:20553008-20553020TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr10:20553011-20553023AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr10:20553010-20553022TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF410MA0752.1chr10:20552977-20552994TGCATCCCAGAATATTA+6.14
Enhancer Sequence
TTTAAAAAAG CAATAAATCA ATAATAAATT TACAATGAGA AGGATCTACA CTAAAGAATC 60
CAGTTTAAAC ATCTAAAGAA TACAATTTTT GGGGAAATAC AGAAGTTTGG ACATAAGAAT 120
TTTTTAATGA AATTGGAAAA GTCAACCCAA AACACTTTAC AGTAAGTACA GTCCCAAAAT 180
AAATGGTTTA GAGTTTCATC ATATTGAGTA CAAAATTAGC ATTTAGGGGA AATATTGTTA 240
TTAAATTTAG CTAGTTTGGT ATTTATTGGG TAGCAATCTC CTCATCTACC ACCAGTGTAG 300
CATCCACCTG GATGAAGCGA CAGCAGCCAT TTTACACCAG ACCGCACACC ACAGAGAGAG 360
AAGAAAGAGT AATGAAGCCA AATTATTATA TGGGGGTGGT TGGGAGGCCA TGGTGGACAG 420
AGGCCAGTGG GTAAATTTGG CCAGGATCCC GGGGTTAAAC CCGTAATGTT TTTCGATAGA 480
CATTCTGGGA TTTTAGGGTA TATGCTGAAG CATGCTAATA GGACTTTTAG TTTGCCAGTA 540
ACCTGGGTTA AGCGCTTCCG GCGAACTGTA TGCCAAAGGA AAAATCTGCA CGTTTTTAAG 600
GTCTGTTTTC TTTCAAAATC AGCGATCTCC ACTGGCTGAG TGATTTCCGA TATGAAGTGG 660
GTCTCAGATT GTACTAGAAG CACTGCATTA AATTACATTT TCCCCGCCAT GTCTTTATAA 720
TATGAGCATT TATTTTATAT TAACACTAGC TCGGCATATA CCCAATTATA TTCATCTGTC 780
TCCATATTCT ACTGCATCCC AGAATATTAC ACAGCACCAA AAATGTAAAA AAAAAAAATA 840
TATATATATA TTGATTATAT TCAATATATT TTTGTGTACG GCAGACGGCA ACTCGACGTG 900
ACCCGCAGGG TAAAGTCTAG ATCGGATATG CGGCCGTCCG GAAGTGCGAT ATGCGCATTA 960
ATAAAGCAGC AATTTTTTTA ATGACACTGT ATAACAATAA TTAATATTTT TACATTACTG 1020
TGACGGTTGG GTGTAGGGTT GGGGTGGGGC TAGACGTTAA 1060