EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:11324198-11325321 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr10:11324482-11324492AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr10:11324482-11324492AACACGTGTT-6.02
ELK3MA0759.1chr10:11324629-11324639TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr10:11324629-11324639TACTTCCGGT-6.02
ETV4MA0764.1chr10:11324629-11324639TACTTCCGGT-6.02
SOX13MA1120.1chr10:11325094-11325105AAACAATGGCA+6.62
Sox1MA0870.1chr10:11325254-11325269CTCAATAGCATTGTT+6.47
Enhancer Sequence
TTAACGTTAG AATAACAAAT TATGCTCATG TTATTCTTGG AAAAGGGTTT TATGATGCTA 60
CTTTTCTTTG ACTAATCTTC ACGTGAAACT AATTCTAGTC AGAAGAAGAG ACTAACAATC 120
TGAAATATTC TGATTTATAA CAATTAGCAT ACAATGAAAA ATAAAATGTA TTTTGCCTGA 180
CTTTTTCCTA ACCCAAACGT TATCAAATAA TTAATGCTGT TTCGTTTTTC ATTAAACATT 240
TTTGAAATTA ATATAAAACC TGAAAGTTTT GTTTAATTAC TTTAAACACG TGTTGCACAT 300
GAGCTGTTTT TTACACGTCG ATTTAACCAT CACTTACACA TTCATATACG GTTTTTTTCG 360
CATTAAATTT ATCATTATTT TAAGAGACAT ACTACGACGC CAACACTGTC TTATCATATA 420
TCTCGGACAC GTACTTCCGG TGTTAGCGGA AGCACCCGCT TCACGTCCAT TAAAAGCTAA 480
ATTGATGGCT TTTCTATAAA ATACTGTCAA ATATTGAAAA ACCGCGGATA AATGACAGTT 540
TTCCAGTGAC AAATGATGTT TGGTATCGAA CAAAAAGGCG GCGAGCAGCA GACGTGAGCG 600
GACATTGGAG CTGAATCTCC CGAATGAAGG TATGATGCTT TTTTCCGGGC TCTTTGTGTT 660
TATGCAGATG ATCAGACTCA CGAGCTCCGT GTCAAAACCC AATCAGCTGT CAACATTTCT 720
GGACAGTTTT GTGTGCTTTT GAAATCTAAT ATCGTTAATG TGACCACGAA AAGCAAAACT 780
TGTCTGTTTA TGCAAATCGC TCGTGCTGTT TTTAAAGATA ACGTTACACA TAGACGTAAA 840
GGTTTTGTCG TTACATGTTA TAACACTGAA CATAGTGTGA ACAGTGATAA TGTTGTAAAC 900
AATGGCAGTG GGTGGGGATG TAGTTTATTG TTGCTAATAG GGGTGTGTCT TCAGGTTACT 960
CTATTAATAA AAAGTCGTGT TTTTAACGTG CTTTTTTGAT AGCAAAGTAT TGTCGGGAGT 1020
ACCTTTTAGT ATTTTGGTAA ATTAATAAAG TAATCTCTCA ATAGCATTGT TAATATACTA 1080
TTATATGTCA TTGTGGTATA GTATGTTATC GTAAGGGGCA GAA 1123