EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01760 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:6041817-6043309 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr10:6042051-6042063AAATAAACATAC-6.11
HOXB9MA1503.1chr10:6042984-6042994GTCGTAAAAT+6.02
HOXC10MA0905.1chr10:6042984-6042994GTCGTAAAAT+6.02
HOXC11MA0651.1chr10:6042983-6042994AGTCGTAAAAT+6.02
Hnf4aMA0114.3chr10:6042262-6042278CAGTTCAAAGTCCGAA+6.05
IRF1MA0050.2chr10:6042301-6042322ATGTGGTTTCACTTTCGGTTA+7.15
IRF2MA0051.1chr10:6042300-6042318CATGTGGTTTCACTTTCG-6.23
IRF3MA1418.1chr10:6042304-6042325TGGTTTCACTTTCGGTTATGG-6.17
IRF4MA1419.1chr10:6042304-6042319TGGTTTCACTTTCGG-6.21
IRF7MA0772.1chr10:6042305-6042319GGTTTCACTTTCGG-6.37
IRF8MA0652.1chr10:6042305-6042319GGTTTCACTTTCGG-6.4
IRF9MA0653.1chr10:6042305-6042320GGTTTCACTTTCGGT-6.65
Enhancer Sequence
CAAGTAAATC TCCCTGCTTA TACGAGCGTA TGGGACGCTC AGGGGGTTCA GGTGTCGTGC 60
ACACAAGATG AAAGGGGTAG TTCCGGTAAG AGAACAGGAG AAGGATTCCC AGTTTTGTAA 120
GTTTAATCAA GCTGGAATGT CATTACACAC ATGTGGTCTA TAAGACAGAA AAATACAAAG 180
AGGAACAATT GCTAATGTTA GTAAATTATA CAACAAACTT ATTAATTAAG ATACAAATAA 240
ACATACATCG AGTAATTGTG AATTATAAAG ACAATGATGA ATTAAACATA CTGTTGTAAG 300
CAATTGGAAT GACCATTTAG TATTATTGTA CAGGCTAAAT CTACCCAACG GTGAACATTT 360
TACGAATTAT TGACTCAATC AGGTGATATA TATTAAATAG ATACATAAAA TAGGTTATAT 420
CAAACTATGA ATCAATGTGA ATATCCAGTT CAAAGTCCGA AATGAGATCG TTGGGTTTGA 480
TAACATGTGG TTTCACTTTC GGTTATGGCG CACGTGGGAA TCACGAGACA TACAGTGTGA 540
TTTACAAGAC AATAACAGTA ATCAGAACAT TTATCTGGAT CAAAGGATAG CAAACAAAAG 600
GGACTCACCC ATAATCAATT ACACACTGGT GTAAAACATG TACAAATCGG TTGCACAGTC 660
CAGCCAGCCG ATCGGCAGCC TGTGTCTCTC CAGCCGTCAT GACTGCCTTT TTGTCACTGA 720
ACTCCCTATC ACCAAACCTT CCTCTAGGGG TCGTTAAAGG GCTTTCTCAC ACAGCCGCCC 780
CCAAATGTAA GTGAGTACAT TTGAAATAGT GAGATATCCT AACTAAGTAT CGGGATTAAC 840
AGGGTCATCA TCAGTGTGTT TCGGTAGAGG GACTAAACGA GATACGGGTC TAACATAAGT 900
GCGGTTGCGT ACCTGAACCT CAACCGATCT GGTTCGCCCA TCAAGTCCAG GAAAGGTATT 960
AGTTACTTTC CCTACTGGCC AACATGCTCG TGGGAGTTGT GGGTCCACTA TCAGTACCAC 1020
TTGGTCTAGC CCAATTTCCC CACCATCTTT GCGCCACTTC TGCCTTTCTT GTAAATTTGG 1080
TAAATAGTAG TGTATGAATC TAGACCAAAA ATGGTCAGCA AGTATTTGAC TATGTTTCCA 1140
TCTTCTGGTT CCCAGAACAT TACTTGAGTC GTAAAATACT TGTGGGAGAG AAGAATCATG 1200
GCGACCCATT AAAAGAATGT TGGGTGTAAT AGGGTCCAGA TCCGATACAT CGGAAGACAC 1260
ATATCCCAGA GGCTTGGCAT TTAGGATGCC TTCTACCTCG ATGAGCACTG TTCGCAGTAC 1320
AGTCTCAGTC ACTGTTAGAT CCTTCAATAC TACTTTAAGG GCCTGTTTTA CTGACTTAAC 1380
CTCCCGTTCC CAAACTCCCC CAAAATGAGG GGCTCCAGGT GGGATAAATC TAAATGTAAT 1440
TTGTTGTTCT GCCAATTGCT CTCTGAGTTG GGGAATCATA GATTCGTAGG CT 1492