EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01739 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:5059369-5060321 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr10:5059422-5059434ATTGTATCAATT-6.22
DMRTC2MA1479.1chr10:5059422-5059434ATTGTATCAATT-6.27
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:5059597-5059615CTTTACTTACCTCCTTCC-6.17
Foxd3MA0041.1chr10:5059373-5059385GATTGTTTGTTT+6.92
Foxj3MA0851.1chr10:5059375-5059392TTGTTTGTTTACCTGAA-6.4
IRF1MA0050.2chr10:5059627-5059648CACATGAAAACGAAACTGAAA-6.11
IRF1MA0050.2chr10:5059633-5059654AAAACGAAACTGAAAATGAGT-6.73
IRF3MA1418.1chr10:5059630-5059651ATGAAAACGAAACTGAAAATG+6.94
IRF7MA0772.1chr10:5059636-5059650ACGAAACTGAAAAT+6.74
IRF9MA0653.1chr10:5059635-5059650AACGAAACTGAAAAT+6.62
Enhancer Sequence
ATAGGATTGT TTGTTTACCT GAATTTTAAT TTTGAATTAA ATTCTCAAAA ATTATTGTAT 60
CAATTGTTTT TAAAGATTTT AAATTCTTAT TTTCCCTTAA CATTTCCCTG AATTTCGGTT 120
ACAGTTAGTT TTATGCTAAT GTCGAATTTT TAATTACGCC TGCAGCAAAC GAGTATTATT 180
TTAATATATA CATTGAGATG TGACTAGACA CGTTGTCCAC AACACATACT TTACTTACCT 240
CCTTCCTCAT CATAAACACA CATGAAAACG AAACTGAAAA TGAGTGTTGC CTCTACTATT 300
ATTTACCACA CACTCTTCGA AAGTGTGATA AACAGAATTA GTTATTTTAA CATAATTTAC 360
GTTGACTCAC GAGTTTGCTG ATGTGCTGTC ATTGTTTTAT TCATATTTAG CTTGAAAACG 420
TCGCTAGCCA AGCGGTCTCA GAAACCTCAA CTCCGCCCAC CCGGCGACGT CACACCCCTT 480
TAGACCCGCC TCTGATTAGA ATATATTCAC CATCTCTGTC ATAAGTTTTT TTTTCAAAAG 540
AAAGACTCAA GAGCTTCAGC ACAAAACAAT GCCTGCTGGA TTTAATCATG GACGATAATC 600
AGTTGCAGAG CAGTTTCTCT GTAACTCTGA CCTTTCTGAA CGAGAGCGAC GTGAAGGAAG 660
ATCTTCCAGC AGCATCTCTA CAACACCAGG AGCTCACGCT TCAGGTCCAC AGAGAGCTGG 720
AGGACATCAA TCTCAACATT ACTGACGGTA AAACACGAAC ACATCCTGCT TTAGTGTTGT 780
ACAGAGCTGC AGAAATTAGC ATTGATTAGC CGAAAAGTGT TTTATGGTTG TGTTGTGTCA 840
GTGTTGTTCA AATGTCACCG ACTTTTACGG TATTTTGGGA AATGTGTACG TTATGGCAAG 900
CCGTTTTTAC ATGTAACTTA GTCCATAGCC CGTACTAGTA TCTATTTTCA TA 952