EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01708 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr10:2871416-2872554 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr10:2871740-2871751GTAATTAATAT-6.02
FERD3LMA1485.1chr10:2871597-2871611GCGACAGATGTCGC-6.08
IRF1MA0050.2chr10:2871932-2871953GCGTAGTTTCACTTTCATTTA+7.62
IRF3MA1418.1chr10:2871935-2871956TAGTTTCACTTTCATTTACGT-6.13
IRF8MA0652.1chr10:2871936-2871950AGTTTCACTTTCAT-6.06
IRF9MA0653.1chr10:2871936-2871951AGTTTCACTTTCATT-6.38
Enhancer Sequence
GATCTGAACT AAAGTAAGTT GGAGGAAAAC CCCATGTAGT ACCTTTCATT TCTTTTGATT 60
TTGTCTAATT TTAAAACCAC AATAAAAATC ACGTTTCGTT TTGTTACTAA GACGTCCAAT 120
AAAATGTAAA TAATCGATTT TGAAACGTAT CTATTTTGTA ATAAATGTTT TTTGACCCGC 180
AGCGACAGAT GTCGCTGTTT TTCCCAGCTT TAAAGCGTAG CTCATTAATA TTAACAAACT 240
TTTGATTACG TTTCATAGGA AACGTAAGCT TATTAATATT CAACAGCCGG ATATTCGCGC 300
TGTGATTCGC TTACGGCACG TTACGTAATT AATATTCATG ATAAACAGTG TTCGCCTCAG 360
CGTTTGAAAC GCTGTTTATT TTAACAAAGA TAGCGTTATT CGACATATAT AAAGCTATAT 420
CGTGTGTACA TGCAGTTATA GCATATAATA CTATAATATG AGGGCAAAAT GAGACGTCTG 480
ACAAACCAGG AAATGCGATT GATTTGGAGG ACAACTGCGT AGTTTCACTT TCATTTACGT 540
TACCAATCGG ATATCTTGCA GGTTCGTTCG AAACTTTTTT TCGCCTATTG TAATTAATGT 600
CGTATAATTC GTGAGCATAT TTGTCGCTTT GTGACGTCTA AACATCGCAT ACTATCTCAT 660
GTGTGTCAAA CAAGTGACAA GAGCACATAA TCCTAATCAA ACGCTCTGAA AGCTGACGTT 720
AAACTCATAT TTTCCGCCAT GCTATTCTTA GCAAAGTATT TTCATTTTAC ATTAGTAGCT 780
TTGTTCTGTG CTCTTTTTGC TGGCAACCAT GCCATGACCG TCAACAAGAA CAAAACCGTG 840
CTGCCTTTCC CCTGGGATAA GATGAGGTTG CCAGAAATTG TCAAACCCCA GCATTATGAC 900
CTCCTCATTC ACCCCAACTT GACCTCTCTG ACGTTTACTG GAGAGGTTCA GATCCAAATA 960
GAGGTAAAAC AGGACACGAG GGCAATCATC CTCCACAGCA AGAACCTACA GGTCTCCAAA 1020
GCTCTTCTTT TGGGCTCCAG ACAACATCAT CATCATCAGG ATCTTCAGAT CAGTGAGTTT 1080
GAAGCCAATG AACAGATTGC ACTCTTCTCT GAAGGCTTCA CTTTCGAGAA AGGGAGCC 1138