EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01587 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:58373085-58374530 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:58374289-58374300TTTTATGGCTC-6.14
Nr2f6MA0677.1chr1:58373750-58373764TGACCTTTGACATT-6.96
RXRBMA0855.1chr1:58373750-58373764TGACCTTTGACATT-6.13
RXRGMA0856.1chr1:58373750-58373764TGACCTTTGACATT-6.07
RxraMA0512.2chr1:58373750-58373764TGACCTTTGACATT-6.17
Enhancer Sequence
TTAATTCGTT TGCTCATTTT CCTCCTTCAT TCCAAAGATT TGCAATCATT ATAATGAAAA 60
ACGGTTTGTT TGATTTTAAC CTTTTATTTC CTCGTGTCTT TATTATTTAA CCGATGTTAT 120
TGTTTGTATA TTATGTTTTT TTCTTCTGTT AATTATTTGA TAAGATGGCT GGAGAGAGGC 180
GACTCTTCAA CAGGATCGTG AAGCTGGCGT ATATAAATTT AAAGCACACT GGGACAGATC 240
AGAGTTTGGT TGTTTGTTTT TTTTTGCTAA ACTGTCATCA GTTATGCTGA GGAATTGGAG 300
AATTATTATT TATAAAACCA GTGTTTCATT TGCTTCAAAT GGTTGGGATT TCTTTAACTA 360
GGTTGATTTT CTAAAGTTAT ATATTTCTTT AATGCGTGTT ACTCCCACAT TAAAGGTCTG 420
CGGCTGTTAA TTTTCTATTC TGTCCTGAAT GAAATGTCAC TTCAGTCTTA TCGCGTCACA 480
CAACACTGCT TTATTTATTT TATTCTGATT TCCCCATCTA AGCTATTTGT CCCTCATTCT 540
ATACAGATCT TAGTAATAGT AATAGAGTAA TAAATAAAGC ACAAACCACT GTTACGCCGC 600
GTCTTACAGC AAACGCGACG CGCGGCCATA ATCAACGGTC AGCACAGAGC GCGGGAAACT 660
ATTGTTGACC TTTGACATTA CCCTTCAAAC CAACTTTTAG CCATTTTTGT TCCTGCAGTG 720
CTTTGAAAAT GGCTAACGCT GTGAGGAAAC TCTTCCTGCT TGATTTATGT TGCTGGTTTA 780
TCCTGTCAGT TGTGTTCGAG TGTCAAATAA ATCGAATAAC TTAAATCCCG ACTCGTTTTT 840
TGGGGTTCTG TGAGTGTGAG GAAAATGTTT GTATTTACCG CTTTCGCGCG CGCGCATCAG 900
GTGAACGGGC ACGCACGGAG AGGCTCGTGA ACGCGCTGCG GTGATCCACC CGATTCATCT 960
GCCTCGGATC TCATATAAAC CACGATGTAA GTACAAAATA CTAAGAGCGT TTATTTGATC 1020
AATACCTAAA TATATGTGAC TGATTGAGTT TTGCTGTCTT TTCCCTAAGT AATGAACGAG 1080
ACATGGCGGA AATCTGAAAG TTTTCCTTCA TCTGCAGTTA TTTATGATGT AGTAATATAG 1140
ATTTCAGCAT GTTTATGGGG AATATAAACA CTTTAAATGG CTTTTCACCT CGCTAAATTG 1200
CGTGTTTTAT GGCTCGTATT AATGTTAAAT GACAGGGATG CTGATTAATG ATGAGGGTGT 1260
TTTGGGATTA AGTTTCTCCG CAGTGCGGCA TGAAGAAACT TTCAGGTTGT GTGTGTGTGT 1320
GTGTGTGTGT GAATATTAAA CCTAAATTTA CAACCTAAAT TGAGGTTCCT ATGAGTTAAA 1380
TGTCTTGTAT CTTAAATCCT ATGTAGAAGT GCAGTGTTCT TTCTGTGAGA GCAGGTTAAG 1440
GGATA 1445