EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01561 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:57865372-57866773 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Dlx1MA0879.1chr1:57866698-57866708CCTAATTATC+6.02
Foxo1MA0480.1chr1:57866179-57866190TGCTGTTTACA+6.14
GRHL2MA1105.1chr1:57866575-57866590GCAAAACCAGTTACG+6.11
Nkx3-2MA0122.3chr1:57866098-57866111CTTAAGTGTTTAT-6
Enhancer Sequence
AAAAGTCTGA CATGAAGATC TGCTCAAACC TCTGGCTGGA GTTTCTCTCC TCTTTCTCTC 60
AGCTTGGCCT CCAGCGACGC CACCTCTTTC TTCAGCTGAC AGATTTGACT GATGAAATCC 120
TCAATATCCA GCATGGACAG ATCAGTTCCT ACTGATTTAC AGCAGCTCAC GTCCACCTGC 180
ACCTCCATGC TCAACATCTG CACACAAACA CCACATCATC AGCAAACACA CGCTTTAATA 240
ACAGATCAAA CAGTTACACA GAACATGTTT AGGCGTTTAG ATTTTCACGT TAACGTTTTC 300
AGACTGTAGT TAATATACAG CATAACACTA ACAAGTGATC AAATTGATTT AATTTAATAC 360
TAATATTTCG TCGATGGCTT TATTGAACTT ATTTAGCGTT ACGTGAAATT AACGAGATAC 420
GGCGTGACGA AGCAGACACA TTCGCGACCA TCCAAACGAA CAAAATCAAC AATATCACAA 480
ACAGACACGT CAAATAAATC TAAACAGGTG TTAATGTTAA TTTAATAGAT GGTGTAAAGC 540
ATATAAAACA CGCACCGGGG GACTGTTCAA ACTGTAAGCT CCTGTGTCGC TCGTTCTGTG 600
GTGGTTTCAG GGTCGGGAGA GGAGCTCCAC CGTGCCGCCG CCTGTGCTGG AGCGACATCG 660
CACATTATTA ATATTATAAT AATTGAAAAT ACTCAAAACA TGGGGGATTT AGGAATAAGC 720
TAAATCCTTA AGTGTTTATC ATTTATCTTG CTTTTATTTT GAGAATGATT CATTTATTTT 780
AACGTGAATT AAAATGTAAT ACTGAACTGC TGTTTACAGC TTTGTGACTG CTGAAGGACT 840
GAGGTGAGCC GTTATTTTCA GTTAAACCGT TTAACGCAGC GAGTTCTGGT CAATTTTAAG 900
CGCGCTTTAT ATCACTACGC TGAATGATTT CAGTTAACAG CTACAACAGT CTAAATTTTA 960
ATAGTTACAG TTGTTTAATA ACAATAATAA TATTCGTATA ATATGACTAG CTTAAAGACA 1020
CTGTAGGGGG TGCTGTGAGG GTTTTCGTCT ACCAGACCGC CAAACCACTG AGGAAATAAA 1080
CACTGGAGCC CTTGATGGTA AGTGTGTTTT GCTGTAATAA CCACTGTTTT ATTACTAATA 1140
ACACCTATAA ACTACTGTAA TATGAGTCAT ATGTTATCGT TAGCTACCAT GTTATTATTC 1200
GTAGCAAAAC CAGTTACGAT AAAAACTGTT GCATTTGTTT TACAGCTCTT TAAAATGTTA 1260
TTTTTAGTAA GACTAACTAA CTTATTTGTG TGTCTTGTCT CGTTACATTA TTGTACTTAT 1320
TTTATACCTA ATTATCATAA ATTTCTTAGT GATTTTGATC TATACAGTAA GGTGTTTATA 1380
CAGTGTTTAC AACTGTTTGT T 1401