EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01554 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:57614359-57614746 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:57614642-57614654GAACAAACATTC-6.14
HMBOX1MA0895.1chr1:57614698-57614708ACTAGTTAAC+6.02
IRF1MA0050.2chr1:57614512-57614533ATTTAGTTTCACTTTTAGTTT+9.09
POU4F1MA0790.1chr1:57614442-57614456CATTAATAATTTAG-6.09
POU4F3MA0791.1chr1:57614440-57614456TTCATTAATAATTTAG-6.3
Enhancer Sequence
TAGTTTTCCA TTTTTAAAAA TAGTGTATAT TTTGATACTG TTTTTAAATT TACTGTACAT 60
TTCAGTTCAG TTGTTGTTTG GTTCATTAAT AATTTAGTTT GTTTAAGTTT AGTTTTTATT 120
TTGTGAAGAC ATTTTTCTAT TTAGTTTTTA TACATTTAGT TTCACTTTTA GTTTAAGTAG 180
TTTATCAGAG TGAAGGGAAG ACGTCCAGTG TCAGCCAGAA CACAGTGTAA TGTATGCAAA 240
GTTTATACTA ACGCTCGTGC AAACCTCATA GTAATAAATA AATGAACAAA CATTCAATAA 300
ATCACAAAAT ACAAACTAAT TTTGAAATGA TGAATTCAGA CTAGTTAACC TAATTAACCT 360
AGTGAAGCCT TTAAATGTCA CTTTAAG 387