EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01515 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:56655949-56657710 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:56656492-56656503TTTTATTGCTT-6.32
E2F7MA0758.1chr1:56657017-56657031TTTTGCCGGGAAAA-6.62
Hmx2MA0897.1chr1:56656488-56656505ATGCTTTTATTGCTTGT-6.4
Hmx3MA0898.1chr1:56656488-56656505ATGCTTTTATTGCTTGT-6.09
NFAT5MA0606.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
SP1MA0079.4chr1:56656268-56656283TGTGGGCGTGGCTGT-6.05
SP1MA0079.4chr1:56656204-56656219TATGGGCGTGGTTTT-6.2
SP3MA0746.2chr1:56656268-56656281TGTGGGCGTGGCT-6.37
SP8MA0747.1chr1:56656268-56656280TGTGGGCGTGGC-6.22
Enhancer Sequence
CTTTGATAAT ATTATGAAAA CACCATAATA AACATGGTGG CATGTAAAAT CTCATGTAAT 60
ACCTTTGCTA TAAACTGGTA ACGTTACAGC TAGAGTGTTT TGAACGGGTA AAATACAATC 120
AGAAGCAATG GATTATGGGA TTTGAAGTCA AATGAAACAC AATAATACTA CTAATGCATT 180
GTTTGAAGGA CATTGATGCC GTTTTAATTA TGGATTTATG CACAAATAAG GCTGTTTCAT 240
GATCCCAGGA GCTGCTATGG GCGTGGTTTT TACGCGTGTG TTGTTATAGT AGGCGTGGTT 300
TAGTTGCGTG TCGTGTGTTT GTGGGCGTGG CTGTGACTGC GGTTGTATGA GGTGAAAGTT 360
TGAGCCGGAC TGTGTGTGTG TATGTGTGTG TGTGTGGATT CTGACTCTCA CACGCGGTAA 420
TGAGCGGTTC ATTCTGGACT GAAACACTCA TTTCTGCTCG CGGTTCGGTC ATGTAGGTGT 480
TGAAGATTGC AGAACTGGGC ATTTCTACAG GCTGGAGGAG CTTGACGGGG GTTTGGAGGA 540
TGCTTTTATT GCTTGTGTTG TCAGCTGTGG TCCTGTGTGG ATGTGCACAG TATTCCAGTG 600
ATCAGTGCAG CTGGACGGGA AGGTGAGGAT TATTATTTTC CATTAGTGTA AAGATTTTGT 660
TGATTTAAAT GCGTTTTTAA AAACAGCTTT TATTCTGTGC TGATGTATTG CATACATAAG 720
GACAATAACT AAACTCCGTT TGCGTTGTAG TTTGCATAGA ATGTTGCACA ACAATTTTTA 780
TAGATTTTCT AAAATCATTA CATTTTATTA TCTAAGCTCA TCTTGAACAT TTTAGTCAGC 840
TTTGTCTGTT TTTTGTATTA ATATTGGCAT GCAAATAAAT GAGATTTAAC GTTTGAGGAC 900
TGTGATACTT ATTTAAACGT GTTATAATAA TATTTAAAGA CTGTTAAAGC AAGAAATGCT 960
GTGAGAGAGG ATGGTCTGGA CATGCCCTTA CTTAGGACAT GTGCTGACAT TTAACCTGAA 1020
GACACTGAAT CTCGAACCGA TTCTTCTGAA GCGATTCTTT TCCATGCGTT TTGCCGGGAA 1080
AAACTGTTTT GGTGAATGAA TTAGTATTCA ACTGTACACT AATTGTGACA ACCATTAAGT 1140
GTTTACCGTG TATATTGTAT ACCGTCTATT TTTCAATAAA AAATGAAACA ATAAACGCTT 1200
CCAAATGATT CGTTCGAATG AGTCGATTCA CTCAAATGAA TTTCCCTCTG CTGGCTCAGG 1260
CGATGAAATG ACGCGGGTTT ATTGAGTATT TCTTCTCCCA CAGTGACGTT CATCTCCATG 1320
TGTTTTCTCT GTTTCTCTCT GTCATGTGTT AGTGATCTGG CTTTAGTAGC TGTTTCGCAC 1380
TTTTCCTTTC GACTCCTTCA TTTAACTCAG TGAATCAAAC CGCGCAGAAT CTGGCCTCCA 1440
TTAACTTCGC GCTCCGCCGC TTAATTGACT CCAGAAAATG ATTTAATAAC GTTAATTAAA 1500
AGCAAGCCGG CTGAAATGGG GGAGATTTGG AGGTCATGTG TGCAGGACTC GTTTTGCTTT 1560
TTCTCCGGAG GACATTTGGC ACCGATTTGA GTGGAAACCA AACCCAGTCT GTTTAATTAT 1620
AATGGCGAGT CATGAACTGC AGATGTTCAG TCATCATTTA CTCGCTCGCA TGAGCAGCCA 1680
AATTCTCCAT ATTTGGTGGA AATACTGACA TATCATTAAC CTGTGTTTCA GAATTACCCT 1740
ATTATCAATT GAAGCTTTAA A 1761