EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01479 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:55014493-55015768 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:55015362-55015373TCTGATTGGTT-6.62
NFYBMA0502.1chr1:55015363-55015378CTGATTGGTTAATGG-6.37
ZNF384MA1125.1chr1:55015092-55015104GTTAAAAAAAAA+6.04
Enhancer Sequence
GTTGTTTGTA AAGGTAAAAT AATATAACAA ATGTATGACC ATAATAAAAT CAGACACTAT 60
GATGATGGAT GTAAAAGCTG TTGTTGTTGT TTTTACACAC CACACCTCCC GAACGTCAAA 120
TATACACATA ATAGAAAATA TGAAGGACTT TATTGAAGGG ATTATTTACA GTTTTAACCC 180
AAAAAATGAG CAGTCTGTCA GATGACGAAG AGTCAGAGAT TCAAATAAAT AAATAAAATG 240
TATGGAAGAT AAGCAATTTC AGCACTCGCA ATGAGTTCCT AGGCCACTCT GCTTACAATC 300
ACAAATCAAC ATCAGTAATC CTCTCACATA ACGTCATTAA CTGCGTCATA CATCTTGGTT 360
TTCTACCCTG ATTGGTTTCA CAGATAGCCT AGGAAAATTT CCATGTGTGT ACGTGCGTAC 420
AATTCTGAAC AATATCTTAA GCATCTAAAC ATCAGACAGC CACTAGACTG TTTAGAGCTG 480
ACTCCAGACC TGTCAAAAGG ATCCATAATC AAATAAAATG CAAACGCTTG AAGTACAATC 540
TGTTAACCCA ATCTCTTACC CAAGGCTGAG TTCATTCTCA GCCATCTTTA TTAAAACTGG 600
TTAAAAAAAA ACTATAATCT ACATTCAGGC AGTTACAGTT AAAAGCAGAA GTTTGTATAA 660
AAAGGCACAT AACCATATAA AAAAGGTCAG GTTTTAATGT GACTAAATTC GGATTATCAA 720
ATTTGTTTCT GTTATGCTCA GTAGCAGAAT AATGAGAGAG ATATTTGCTG AAAAACTGTT 780
ATAACTTTTC TTGAAATTCA AGTTTATACA CAATAATATT ATTCTGCCTC TGAAGAAGCT 840
CAGATGATGA TGTCAAGGTT TTGGAAGTTT CTGATTGGTT AATGGACAAC ATTTGAGTTA 900
TCTGGAGGCA CAACTGTAGA ATAGTATTGA AGGAAAAGCT CAAACACACT GCTTCCTTGT 960
GTGACAACAT GGGAAAATCA ACAAGCCAGA ATCAACAACA AAGGCAGATT ACAATTTGCT 1020
AAATTACACT GGAAAAAGGA GTAATGTTTG GAGACATATC CTGTGCTCTG ATGGAGCTCA 1080
GATTGAACTG TTTGGCCATA ATGACCAGTG TTACATTTGG AGGAGAAAGG GGAAAGCTTA 1140
CAAGCCTAGG AACACCATCC CAACTGTGAA GTATGGGGAC GGCAGCATCA TGTTGTGGGG 1200
CTGTTTTGCT GCAGGAGGGA CTGATCCACT TCACAGCATA GATGGCATCA TGAAGAAAGA 1260
ACATTATGGA GAAAT 1275