EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01472 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:54668979-54669404 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr1:54669021-54669038ATGTTTGTTTATTTTTA-6.72
HESX1MA0894.1chr1:54669223-54669233GCCAATTAGC-6.02
LBX2MA0699.1chr1:54669223-54669233GCCAATTAGC+6.02
Enhancer Sequence
AAAATAGCTT TTATGACCAG TGTTGTGTTC ATATTTATGA TTATGTTTGT TTATTTTTAG 60
TTTTTGCTGT TATATACCTA TAATGTGTTT CTGTTTAGTG CAGCATATTA TTGGCAGTAA 120
ATAACTGAAC TGAACAATTA AGCCTCATAT GTTTCATTGA CATTTATTGA TCACTAAGAT 180
TTAAATGGCT TCAATTTAAA AATGAAAATT GCAATAATAG CTTAGATGTT GCTAAGTTAC 240
TTTTGCCAAT TAGCTTTTAG CTTAGCTTGC TACATTTCCA AGAGGGTAGC TTTTAGTGTA 300
GTTAAGCTAC ATTTTAAGTA GAGTAGCTAA TAGCTTAGCT CACTACATTT ATTTAAGTAG 360
CTTGCCCAAC ACTGCACAGC ATACATTTAT TCCTTATTTA GGTTAAAAGA AAAGACACAA 420
ATATA 425