EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01465 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:54560784-54562290 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr1:54561478-54561492CCCCAGGGGGCGGG+6.46
POU4F1MA0790.1chr1:54561119-54561133TTGCATAATTCATG+6.36
POU4F3MA0791.1chr1:54561119-54561135TTGCATAATTCATGCT+6.11
Enhancer Sequence
ATTTAGTGAT TAGAAAATTA CTGTAATAAA AGACTCAGCA ATTATCAGCC ACATTACACT 60
CCTAGTTCCG CAGCAGTTAT TTACTTGAGA CACAGTGCTA ACTCATCTTG TTCATCACCT 120
GTTTGGCCCT GGCGGCCCCT TGGCCCTTCT GCGGAGGGTT CCTGCTTCGA CTCATCTTCT 180
CCGCAGCTTC TCAAACCTGG AGAGACAACA AAATATATTG AGTTATAATA CAACAAAACA 240
GCAATTACAT CAAGAACAGC CATTCAGCAA CACAACAACC AGCCAAACCA GAACAGACAG 300
GCGTCATGAC GCATTCCTAA ATCATTGCGT GACGTTTGCA TAATTCATGC TTAGACAGAA 360
TAAACAGCAA ATATATATCA TTAAGTGTGA TATAACCCTC TCAGACATTA TTAAGCTTAG 420
TATAACTGCC TACAACCGAA TGTTTCAGCA GTATTGAACA TGCTAATGTT TACATGTTTG 480
AACAAGACAA TCTACAGCGC GCATTTAGCT GATTTTGCAG CAAAATAGTT TGAAGCAACG 540
CTTAACTAAC CCTATAATAA AATCAAACTC ACTTACAATA TAAATGATGA CGTGAACAAC 600
TCATTTAAGT CAAAGTGGCA GCTAGCAAGG AGGCTAGTTT TTACATCAGA CTGTCCTTAC 660
TAGTAATTTG AACGAGATAC CTGAATCATA TGTTCCCCAG GGGGCGGGTT ACGGTGCAGA 720
TAACGGTTCC GTGAGGAAGA ATAAGCTGCC TGTTATTAAG TTTTTGCATA CGAGAGTCAT 780
AAAAACAGAG GTAAACAGAG ATCTGCACTG CTGTCAATGA AGATTCAGCA CTTCCTGCTT 840
TTCGCCAGGT TTCTCATAGC AACGGGAGCC TCGCGCTTTA CGGCACACAG GAACGCCCAA 900
CGGCTCCGGT ACTTGTAGTT CAACCGACAG TCTGTCAATG TACTGGATTC TTAAGTATTT 960
TTTTACGGTT TGTCGTGTAA TTTCTCGTTA TGTCTGAGAA AATGTGGTGA AAACTATATT 1020
TCTTTAATGT GGTAGCTTTC GCGCTCAAAT GTGGTTAGGT AGTTTAATCA TGTCAGCTTG 1080
ATTATTCCTC ATTAATTTGC GTTTAAAACT GTTTATTTGC TTTATTCACG TTGATAATGG 1140
ATTATAAGAA AATATTTAAC TAAACTGACT TAAAGGAGAT CGAAAGTAAT ACATAAATCA 1200
AACATGAAAT CAGTTTTGCT AATACTTTTT TTTTACTCAC CTAACGTTAG CTGAATCTGG 1260
ACTGAAACGA GAAAATGCCC AAAAGAAAAT CAAAGACTAC AGGTAACTTA CATTCACAAG 1320
AACATACTGT TATTATCTTT CATTCACCCA ACTTTAATTC ATCTTAATTG GAGATATGAT 1380
AATAACTATT TAATGTTCAA GTAAAGACAC ACAATGATGT ACATAATTGG GTTTAAACAG 1440
TGCTCAAAGC ACCCAAGAGG ACACAAACCA GAGCAAAGCA ACAGAAAAGT GCTGAGGAAA 1500
CAAATC 1506