EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01454 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:54230658-54231944 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr1:54231056-54231067ATATTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr1:54230873-54230890TAAATATAAACAAAAGC+6.36
Foxq1MA0040.1chr1:54230756-54230767AATAAACAATT-6.02
Hmx2MA0897.1chr1:54230980-54230997ATCTATTAATTGTTTTT-6.89
Hmx3MA0898.1chr1:54230980-54230997ATCTATTAATTGTTTTT-6.46
KLF16MA0741.1chr1:54231442-54231453GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr1:54231442-54231452GCCCCGCCCC+6.02
MNX1MA0707.1chr1:54231910-54231920GGTAATTAAA+6.02
RESTMA0138.2chr1:54231498-54231519TTCAGCACCCGGGACAGGCGT+6.58
RFX1MA0509.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.34
RFX1MA0509.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.35
RFX2MA0600.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.44
RFX2MA0600.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.52
RFX3MA0798.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.42
RFX3MA0798.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.49
RFX4MA0799.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.17
RFX4MA0799.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.72
RFX5MA0510.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.11
SP4MA0685.1chr1:54231439-54231456CCGGCCCCGCCCCCTCT+6.34
Enhancer Sequence
ACATATTCAT ATTTCATTTT AATGGTATTC AAACGTAAAG GCAGATTTAT TGGGGGAATA 60
CATGCTGAGT GAAACTCAGC ACAATCTACT GTTACATTAA TAAACAATTT GAATATGGAT 120
GTGTGGAATT TCTGTGAGGA ATTTTCTCGC CACATTCATT TAATAACCGT CTTGTTAACT 180
GAACTGTTTT GACGCCTTTC GCACTGTTGG CTATTTAAAT ATAAACAAAA GCCCCACAAT 240
CCCTCACAGT CTGGGTTGTT GTTAAAAGGG ATAGAGCTGC GGCCAGAAAT GTATGAAAAT 300
TGTTCTTATT ATTTATTAAA TTATCTATTA ATTGTTTTTT GAACGTCTAC CCCAACCCTA 360
AACCCAAAAT CAAAGTAATG TAAAAACAAA ACAGAGGAAT ATTTACATTA TTTGTTAAAT 420
TAGCTATTCA GTTGTATTTT ATTGACGTCC ACCTCCACCC AAATTCTAAA TCCAAGCCTT 480
ACAGTAAAGT AAAACTATTA ATTATTGCTG TACAGTGTCA CTAAAACATG TATGTAAAGC 540
TGTATGCCAT CTAGACTTTA CCCTCAATCT GACTTACTGT TGCTATGGTT ACCTTCTCAG 600
CTGAACACAG CTTCTCTCCC TGAGCGTCCA CTACTGAGCT TTGACTCGTC TGTATTATAA 660
TACTTGTGCT TTAAAAACAT AAATCCTCAT CACAACATTA CTTCACATGA CTGAAGCCGT 720
TGGAATCTGC GCGGCTTCGG TTACCCCTCC CCCCGCGCGT CAGAACATTG TGTGATTGTT 780
TCCGGCCCCG CCCCCTCTCC GTTTATCCCC ACGTCCAAAC GTTTATTCCC GTGAACCCGT 840
TTCAGCACCC GGGACAGGCG TCGCGTGCTC GCATGGCAAC ATGGCCACAG AGGTGAGCAA 900
CACCCTTTAT CCATTAATGC TTTTCTGCAC CCGCTGTGCT TAAAGACTTG TTTTGTAGGA 960
CACCAGTCCG TGTAATCGGT GTCGTTATTT AAATCAGGGC TGGAGATCAC GGATCAGTTC 1020
GTGACGTTAC AGACAAACTG TCCGTTTTCA CGCGTCGTTT TTAAATCCGA CAGAGATACT 1080
GCTAAACCAA TAACACAGAA TAAACTAAAC ATACAACACA CAGTGTAAGC TACATGCTAG 1140
TCATGAGCAG CTACAAGTTA AACGATTATA AACACAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 1200
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGGCAAG GCGGTAATTA 1260
AATTTTTATT TGAGTCGAAG TGACTT 1286