EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01441 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:54086253-54088112 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6MA0463.2chr1:54087436-54087452CTGCTCTCTAGGAAAA+6.41
BHLHE41MA0636.1chr1:54087240-54087250GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54087240-54087250GTCACGTGAC-6.02
FOXC2MA0846.1chr1:54087139-54087151TTTGTTTATTTA-6.18
FOXD2MA0847.2chr1:54087140-54087153TTGTTTATTTAGC-6.12
FOXE1MA1487.1chr1:54087139-54087154TTTGTTTATTTAGCT-6.16
Lhx3MA0135.1chr1:54086484-54086497TAATTAATTAAAT+6
Myod1MA0499.1chr1:54087278-54087291AGTGACAGCTGCC-6.04
NFYAMA0060.3chr1:54087678-54087689GACCAATCAGA+6.14
POU2F2MA0507.1chr1:54087525-54087538GTCATTTGCATGT+6.08
Enhancer Sequence
AATCCTTATT TAATTGTGGT GTCTTGCATT GTTACGTCAA TGGAAAAAGA GTATTATAAA 60
AAGCACTGCA GGTTCAGACA TTAGCCTACT GACCTCTATA CTCAAAGGCT ATTAGTTGTC 120
CTTAAGTCAC CATTGGCCAT TACTACAGTA GCATGAGCAG TGAAAAACAA GGCTATGCCA 180
CTTCTAAGAG CCCTAAAAAC CCTGGTCATT GCTAAAACAT CTATTATAAT ATAATTAATT 240
AAATGTCAGG TATATATTGC TTTCAATGGA TAGATTAGTC ACACGTGTAA TGATCATGTC 300
TATTCAAAGT GAGGTCAATG CTAATCTGAC TAGCCAAACT TTAGACTCAT TGCACAATGT 360
GGAAATAAAA CTATTTTAAA AAGCAATATG TGGAACAGAC GCAAAAATCA ACATATTATT 420
GGGTGATCTA AATAAAAAAA TAAGAAAGAA ATCTCAAAAC CAGCGTTTAA CACTTGTTAG 480
TCACACTGGA AATGTAAGGT AAATCTGCGC CCACTGCATT GTGGGATGCT AAATAGGTAG 540
GCCTTAACGA CTTGTTGTAT TTACAGAAAA TGTTAAAAGT ATGAGTATGC TATTAACATA 600
AGTGGTTTAC ATAAGGCGGT ATTACTCAGT GATAATCACG AATGACTGGT TAGCTTAGCT 660
TGCTAACACT TGCTATTAAC AGTAATCAAC GTAATCGCGG TTTGTTGATG CATAATGATG 720
GCAGTACGTC AACTGACGTC AATTAAAAGA AAAAATTAAT AACGTACATC TAATTTAAAA 780
ATAATAAAAA GCGTAATTAT AAAAGTAAAC ATTGTTTGCC AACACTGGTT TTGTTTTAAA 840
ATTCCAAAAT AACGCAACTA ATAGAGAACT AACTTCTGGC AAATGGTTTG TTTATTTAGC 900
TTCCGTAAAT ATCTGTTTTT ACTTCCAAAA ATCATCTTTT CATGACTGAA TTTGTCACAA 960
AGCCTACAGA AGTTTGCAGC ACAATGAGTC ACGTGACGAC GTGACAGTGA CGCACGAACA 1020
TCCGCAGTGA CAGCTGCCTG CGCGAGGACA CTGCAAAAAA ACAGCTCTTT CACACATATC 1080
TACTGAAATT AGAGCAAATG AGCGTAGATT TAAAGCATTT CGATAATGAA AATGCTCGGG 1140
TATGAACGAC TCGTTTATAG CATTTACATT CGGTTCCGCT TTGCTGCTCT CTAGGAAAAC 1200
AAATGAAAAA ACAACAACGA CACAATTATG CAAAGGTCTA CCCACCTTTT CTGTCTGAAC 1260
TACTGTCTTT GTGTCATTTG CATGTTAGAT CGTCGGAGTT TCTCTCGGTA AAGCGGTGTA 1320
ATAGTGTAGT AAACAGGCTG GCTGCTGTCT CCGTCTGGGT ACAGCGAGCG AAATGGACAG 1380
AGAAGTTCAA CCCTCTCTAG ACTCGTCACC TACTGTACCC GCTCTGACCA ATCAGAAGGC 1440
AGGAATGAAC GATTGAGCCC GCCTCCGATT CTCTTTCAGC CAATCACATC ACTGCTTTAT 1500
GTGCGTCTTG TAGTGTGCAT TGTACAGTGT GTGTGTGCGT GTGTGTGGTG TGGTGTGAAA 1560
CTGAGAAATG TGTAATCCTT CATTGACGTC ATTGCTGCGC ACACGTGCCA ATATGTGAAA 1620
CCGCCTCTAG AAAAAGAAAC TGTCACTTTA CATGGTTATC ACAAAATATC AAAATATTAA 1680
AAATGCATCT TATAAATATG GTTAAAGAAT TAAAAGTATG TTAAAATTAT AAAAAAAAGC 1740
CTGGTAATAT TTTAAGGAGA CACCAACATC TTTAAAAATA TGTTTATCTA TCTATCTATC 1800
TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TGTCTGTCTG TCTGTCTGT 1859