EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01427 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:53745033-53746369 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:53745530-53745541ATATTAATTAT+6.02
ETS2MA1484.1chr1:53745156-53745166GACCGGAAGT+6.02
FOXA1MA0148.4chr1:53745405-53745421AGTAATGTAAACAAAG+6.01
FOXC2MA0846.1chr1:53745408-53745420AATGTAAACAAA+6.37
FOXD2MA0847.2chr1:53745406-53745419GTAATGTAAACAA+6.33
FOXK2MA1103.1chr1:53745409-53745420ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr1:53745409-53745420ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr1:53745406-53745423GTAATGTAAACAAAGTA+6.19
HNF1AMA0046.2chr1:53745531-53745546TATTAATTATTAAAT+6.02
PBX2MA1113.1chr1:53745052-53745064ATGATTGACAGA+6.22
ZSCAN4MA1155.1chr1:53745724-53745739CTTACAGTGTGTGTG-6.41
ZfxMA0146.2chr1:53745759-53745773GCCGCCGGGGCCTG+6.65
Enhancer Sequence
CCACAAATCC TGAGACGTTA TGATTGACAG ATAAACAGTG GCAGTCTGAA GTATTACACC 60
AGCCAACACT CCCCAGCCAT CACCACAGCC AGATCAGGTA GTTGCTGGAA GGGATACAGC 120
TGCGACCGGA AGTTAATCAA TTATCCATTA ATTGTACTTT ATTAACCTAA GTAACCTCTA 180
TCCCCTCAGT AATGTAAAAA CAGTAATTTC ACCCTGTAAT ATTAATATTA TTTAGCAAAT 240
TATCCATTAA ACTGTATTTT ATTAACGTCT ACCCCTACCT TAAAACAGCA ATGTAAAAAC 300
AGCAATTACC CCAAGTAAAA TTATTAAATT ACTAATTAAG TTATTAACGT CAACCCTAAC 360
CATATACCTC ACAGTAATGT AAACAAAGTA ATGATTACAC AGAGTATTAT TACTATTCAT 420
TAAATTACCC ATAAACTTAA CGTCTACTCT CCCTAACACA GTATTAACAG TTATTAGGCC 480
TACACCGAGT ATTATTCATA TTAATTATTA AATTACCCAT TTAAATTATA TTTCAATAAC 540
GTCCACCCCT AATATTTATT ATTGTCGTAC AGTGTCACAA AAAATGTGCT ATATGATGAG 600
AGTATCTGCA GCTGTATCCC TTCTAGACCA CAACAAACAC CCACATCAGC ACCCATAAAC 660
CCGCCTGGGA CTTCACACAA AGCGACGGCC ACTTACAGTG TGTGTGTGTC GGCGGGCAGG 720
TCGGACGCCG CCGGGGCCTG ATCTAGTCCG ATGTTGGAGC AATTGACCAC GCAGGAGTTT 780
TGGGGTCCCG CCGCCGTGCA GGAGCAGTTA CCCGGGCACG GGGTGCACGC TGCCGCGTCT 840
GCCTTAACGA CCGAGCGCGC CTCCAGGCAG CACAGTGCAA AGAGCAGGCT GGAAAATAAT 900
CCAAACTTTG GGAGACAGAC GCCATGTTTT CGCTTAGACG CAATCTGTCC ATTTCCACAA 960
GGCATCGCTC ACTCGCATCT CATCGCCCCT TCTGTTGGTG AAGTTTTCCT CGGAGGAAAG 1020
TTCACTCTTT TCCCAGGTTT TCCATAAGTG AATCGGCGCA GAAAGCGAAA AGTGCTTGGA 1080
AATCGCGTTT TTTCCCCCCA ACTTCGATGA CGTTCCCCCG CTATTCCTCC GTTAACGGAA 1140
CTAGATTCAC TTCTTCAGAC TAGAGGAGGG GAGGAAAAAA ACTCTGGATT CTGCTCTGCC 1200
AGAAGTTCCT GAAGAACTTC CTCTCGTTCC CCATCATGCA GTGCCGCTGC TCTCCACTGG 1260
ACGAGGCTTC ATCCGAAAAC AAACTGCTGC ACTGCAAAAA ATGCTTTTCT TGCTTAGATT 1320
TTTTGTCTTG TTTCTA 1336