EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01402 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:53122792-53124445 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:53122948-53122959TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr1:53122947-53122960TTGATTAAATTAA-7.34
FOXC2MA0846.1chr1:53122957-53122969TAAATAAACAAA+6.18
FOXD2MA0847.2chr1:53122955-53122968ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr1:53122954-53122969AATTAAATAAACAAA+6.29
HNF1AMA0046.2chr1:53122814-53122829GATTAATAATTAATT+6
Lhx3MA0135.1chr1:53122820-53122833TAATTAATTATAC+6.12
Lhx3MA0135.1chr1:53122817-53122830TAATAATTAATTA-6.18
POU4F1MA0790.1chr1:53122815-53122829ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F2MA0683.1chr1:53122815-53122831ATTAATAATTAATTAT+6.01
POU4F3MA0791.1chr1:53122815-53122831ATTAATAATTAATTAT+6.54
Sox6MA0515.1chr1:53123085-53123095AAAACAATGG-6.02
ZNF24MA1124.1chr1:53124318-53124331ACTTCATTCATTC+6.06
ZNF24MA1124.1chr1:53124330-53124343CATTCGTTCATTC+6.41
ZNF24MA1124.1chr1:53124342-53124355CATTCGTTCATTC+6.41
ZNF24MA1124.1chr1:53124326-53124339CATTCATTCGTTC+6.46
ZNF24MA1124.1chr1:53124338-53124351CATTCATTCGTTC+6.46
ZNF24MA1124.1chr1:53124334-53124347CGTTCATTCATTC+6.98
ZNF24MA1124.1chr1:53124322-53124335CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr1:53123035-53123047TATCAAAAAAAA+6.14
Enhancer Sequence
GCACACAAAT TTTGTTAAAA AAGATTAATA ATTAATTATA CAAGTCAAGT AATGAATAAA 60
TAAGAAAACA TTGTAATAAT ACACGCTTTT CCCCATAAAG CATTTTTCCC AGTTTCACCA 120
TACTTAATCT TAATTCTTAT ATAAAAACAC AACATTTGAT TAAATTAAAT AAACAAAACC 180
ACATTCTACG TTTAAGAAAC TCATTTGAAC ATAATGATTA ATAAAATCAA CGCCTAATTC 240
CGTTATCAAA AAAAACGAGA TGTACGACAG CAGCCACCAA ACCAATGTCA ACAAAAACAA 300
TGGCGGACAC GGTTGGACAT CACACACACA CGCACGCGCG CGCGCGCACA CACACACAGT 360
GATGTGACAG CAATTAACAT GACGAGTCAC AATAAACACA ATGAAGCAGT GGCTTTTGTG 420
TCATTTTGAG CTTCAGTTAT ATAATCTATC GCCATCATAA TAAACAGGCA CACACACATA 480
CACACAGCAG AACTGACAGC TCATCATGAA CATGAACAAA CGTGCCTATA ACACACACAC 540
ACACACACAT ACAGTCACAC ACCAACACAC GAGTGTCTGT GCGAAACACG GTTGTCTGAT 600
AACAATACAA ACACACACAT GCATTTATGC TGGAGGAGGA TGTGAAACGT GCGCGCTCTT 660
GTTTTCTGTT TGGCCGAAAT GCGTAAAATG GTGGACGCGC ATCAATAATA ACAGCACCAC 720
GCATCTCAGC GTGTGGTTTG GATGCGTTTA AAACGCAATG TTGCGCTGAT TGAGATCAAA 780
ATAGATTTGG AGAGATAAAT AAATAAGGGT GTCTTGCGTC CGAGCAGCAT CCCGGACAAG 840
GCCGAGCATC CGCGCCGGAG CATCACTGGC CGCCGCGACC AGTGATGCTC CGGCGCGGAT 900
GCTCGGCCTT GCCCGGGATG CTGCTCGATG ATGGAGGAAA AAATAAACAA CAACAGTACC 960
TGGCAGACGC TCCGCCAGAC GGTGGGATCG GTTCCGCGCC AGCCCGGTGT GAGACAAACC 1020
CAAACCCGCA CGCAGATAAT GCTGCTGCTG CCGCCGCCGG TCGGTCGGTC ATGAGGAAAA 1080
CGGAGGCACG CGCGCCCGTG ATGTGGCCAT CATCATCTTC GTTACCCCGG TGAACCGAAT 1140
GACCCTGGAT GAATGGCGTA ACCCGATGCA GAAAGCGCGG TGACGGCGCA CCCCGTCTCC 1200
AGCACTCGAA TTTACCCGTA TCCTACTACG CCGAGGGCCC TGCTGCTTAA TTTTTAATGA 1260
GATGAGCGTC GGGATTGGAC TGTAGGGCGG GCAACGTCAG ATTTGAGCTC ATTAATATGC 1320
AGAACGTAAG CCTTCCGCAT TGGAGGATTA ACGGACAACG TCAGCGAGAG ACGATTTATA 1380
TAAATTACAC AAACAAGCTT TATTGGCTTG GATGCTGGTA TTTAAGCACA ATTTTCCCTA 1440
AACAAGTACA TATTTTTGGA ATAATAGATG TATTTAATAT AAAATTGGTC TCCTAAAATT 1500
GGTAGGAAAA TGATATTGGT TAGACAACTT CATTCATTCA TTCGTTCATT CATTCGTTCA 1560
TTCAATTATT TTCTATTTTG CTTAGACCCT TTGTTAATCC GGTGTCGCCA CAGCGGAATG 1620
AACCGCCAAC TTATCCAGGA TACGCAGTGG ATG 1653