EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01392 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:52849809-52850730 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:52849947-52849960AACTAATTAATTA-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:52849950-52849963TAATTAATTATTT+6.71
mix-aMA0621.1chr1:52849948-52849959ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TTTTGGAGAC TGACATCCAG TGGTCACTGC AGTTATGGAA AATATACGTG TAAATTGTTT 60
TTAATTCAGC GTTTTTCTTT TTGTTATAAT TCAAGAAATG TATGATGATT ATGTAAAATT 120
AAAGATTTAT AAAATTAAAA CTAATTAATT ATTTCGGAGT GTGGGGGTAG CCTACTGCAT 180
ACGGAAAGTC ATTATTGAAA TAGCAATATA ACACAACAAT AACTTAACGT TTTACAAGCG 240
AATAACAAGG ACACCCAACA ATGATAACAT TAAAGTCATG TAGTTTACTA AGATATTTGT 300
GATAATGTTA TACTAATATT CAACAATTTC GACAGATTTT GTTTTGATAT TCAATAAATC 360
CTACAATCTG TACCTGTTGG TGCAGGTGTG CGACAGTCCT CACCTTTATA ACAGCGGTCC 420
ACAACTGTTG TTTCCTCACA AACTGAACAT TTTCCTCTAT CTTTCACTCA TAGTCCACCG 480
ATCAGGACTG TAGTAGTTGT TTGTTTCTTT GGTAAATCGG TAAATTCCCG TTTAAAGTCA 540
GTTTTCCATA CTCGTTGCGG TCCCGCGTGT AGAGGAGTCT GGTCCAGAGT CTCCTCGCCG 600
AGCGAGCGCG CACACGACAG AGAGAGCGCG CCTCCCTAAC AACGGAAGCT CGCGCAGGGA 660
TGCCCAAACT TTTTCCTATA AAGGGTTAAA AAATAAACTT AATTGAGAGT GATGGACTGA 720
ATTAAAATAA ACCAAACTGT ATTACATTAA AGTTCCCACG GTAATTTCCT AATGCATTAA 780
TGTTTAAAAA ATAGATTCAT CCTAATCGTA TTAATAATAA GTATACATTT TGTTTACAAT 840
GCATACACAG TCCCATCTGT AACACAATGA CGTTCAATGC TAAAACTAAA TCAAAATCGA 900
AACAAACATG AAAAACACGA T 921