EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01353 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:51997924-51999426 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:51998038-51998057TTTCCGCCAGATGGCGCTA+6.41
ELF1MA0473.2chr1:51999195-51999207CATTTCCGGGTT-6.18
NKX2-3MA0672.1chr1:51999320-51999330TTCAAGTGGT-6.02
Enhancer Sequence
ATCTCTGTAA CACTTAAAAA TTACGGTTTC AAGCTGAGAA CTCTATCGTT TGTGAAGCCC 60
TGCCGGAACT TCCACGTTGA AGCCGAAAAA CGGTCGCGAA CCAGTTTATT GTTCTTTCCG 120
CCAGATGGCG CTAAAGTCAA AGAAAACGAG CCCACTCACG GGAACGAATT GATTTGTTCG 180
CTCGGCTCGA GTCAATGAAT CTCTTCAAGG CTCTATGCGC AAATGTTTTC GCGGCATTTT 240
AAAGAATTAA ATACCCATAA CACCAAGTTC ATGTTTATTC GACATCCCGT GTGGTTGAAT 300
GTGATTCAGC CACAATGATT AATTATTTAA AATGTGCAAA TCGCCAAATA AATTCGCATG 360
TTTGTCTTTT CCGATCTCAG CTTTAGTTCA CAGAAATAGA AATAGCACTC CTGGGTTTGT 420
CATTCAAAGT GAATCATATT AACTGAATCA CTTCAAATGA ATCGCATTCC AAAGAGCCGA 480
ATATGTTTCG CGAATCAAAC CTGACCAATT CAATGACATT ACTAGTATAT GCCACGCGTG 540
TGCGGTGTGC CTGATCTTAA ATTAATCTCT CATCAGGTAT GAACAATCTG ACTTCTTCAA 600
CTCTTGACAA TGTATGTTAC TCTGGGGGGT GACATATTTG CAGACATTTC GATGGTCTCC 660
GGTGTGACAG AGGAAAAGGA GGAGCAGAAA CGCGCTGCTC CGCCTTCACA TTATCGCGGA 720
GTTCTCAAAG GAGAATTACA GCACCTCAGA TCCTGAAAAA CACATCCTCA TTATCCATTT 780
AGAGACATTA GCGGCTTCAG TCTGATTTAT ATTCCCGCGC GGCTGCTGAA GAGGACGTGT 840
GTTTGTTTAC GACGCCATTT TTAAAGTATT TATTTACCGC GGTGCAACTT TTACACTCAT 900
TCCTCCGAAA CAGCAGCAGG ACAACTGGCG ACTCCCTAAT TTTGTAGTTT TTTTTAGATG 960
TGTTTGTGAT TCTCATCAGC TCAGGAATTA TGGGATGCTG CGGCAGCACA CAGGTAAGAA 1020
ACACAACATG GTGTAAATGC CTGCACATTC ACAAACGGAA ACTTTTTTTA ACACTTAAAC 1080
AAGCGCGTGC AGAGTGCAAA CGTAAGGTTA AACTCTCATA ATCCGATCAT TCAGATACAA 1140
TTAAGAGTCT TTCAAAATTG AGGTTTATTC CAGAGAACGT TTGTAAATTA TATGAGGTAT 1200
CCTAAAAATG CATATAACCT AAAATATTAC AAAAACGAGG TCAGGGTTTT GTTTGTCAAC 1260
ATTGTGAAGC TCATTTCCGG GTTTTACTGA AAACGAGGCC AGGTGTGAGA CACTCCTATT 1320
CGTTTACCAC CACGCTTCAT GCTTTTAAAA GACTTTTTAT GTTGACAGTT CACCCGAAAA 1380
TGACGTTTTA CTCACTTTCA AGTGGTTATC AACCGTTATG AGTGTCTTTC ATCTGTTGAA 1440
CACAAAAGAA GATGATATAA AACCGATAGC TATTAATTTA CATAGTAAGA AAGACAAATA 1500
CT 1502