EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01314 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:50911515-50912651 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:50911992-50912011TAGCGACATCTTGTGGTAA-6.12
FOXF2MA0030.1chr1:50912289-50912303GCAACGTAAACAAA+6.75
HOXC13MA0907.1chr1:50912064-50912075GCTCGTAAAAT+6.32
SOX15MA1152.1chr1:50912144-50912154AAAACAATAG-6.02
Enhancer Sequence
CTTAGAAATC TGAGGTTATT TCTTTGCTGA ACGAACACGA ACACACGAAC GAACACACGA 60
ACACACGAAC GAACACACAC ACACACGAAC GAACACACAC ACACACACGA ACACACACAC 120
ACACACACAC ACTATTTTAA AGAAAGTTGC CGTAACCATT AACTGTTATT TGTGGGGAAG 180
TCCGGGTTTA CAGGTTTTCA GCTTTCTTCC AAATATCTTC TTTGGGTTTC AACAGAAGAA 240
TCCAATAAAG ATGTATAATC ACTTGAGGGT GAATAACCAA AATAATGCAT AAGTGTTCAT 300
TTTTGGTGAA CTCGACGGCC CTTTTAACGT AGTTGAGTGA TTTAAAAAAC TTAACGAGAA 360
TCTACACAGA ACTGTTGTTT TAAAGTTTCA TAGACGTAAA CTAACCTTGG CACACAGTTA 420
AATGAACAGC GGTGTCCTCG TTTGATTGCC TCCTCAGAGC GTTTGTTTGT TGTTTCTTAG 480
CGACATCTTG TGGTAAATAA ATAAACTACA GCTTGAGGGA TTTTAAGGAA ACTCCGTTAA 540
TAGATACATG CTCGTAAAAT ATTATGCTTA GCTCTATCTA AACTGGATGA TAAACATATA 600
GAAATAAAGA TCAGTCGTTT ACAATATTAA AAACAATAGT TTATGCAGAT GAAAATGAAC 660
CAAAGTAACA GTAAATAAGC CGACATGTGT ATGCTAACTA TCAAAGTTAA TTTTGATATT 720
TGCTTAACAC CCCCCCCCCA TATATTATTA TTTTAAAACA ATACATGTAA GTGTGCAACG 780
TAAACAAACT TACACCACAA AACATCACTG AAATCTCTCC GTCCTCTGCT GATACTTGCA 840
CGTTGTCGTT GTGGCGTTTT CCCGCCTGAA TGTAATTTCC TGATGGAAGA CGTCAGTAGC 900
AATGTTTATG TTTGGTTAGA ATTAACAGAA TCAAATAGGA AAACTTTCAC ACTAGTAAAC 960
CAAGGAAGCA TTTTCATATA ATAATGGATA ATATATGTTG GTCAGGGGTT AGCACCTACG 1020
CCTCACAGCA AGAAAGAAGG TTGCTTGTTT GAGTCCCTGG CTGGGTCAGT TGGCATTTCT 1080
GTGTGGAGTT TGCATGTTCT CCCCGTGTTG ATGTGGGATT AGAAACTTAA ATGTTT 1136