EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01238 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:48279972-48280604 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr1:48280383-48280397TTTGTTTACGTTTG-7.64
Foxj3MA0851.1chr1:48280380-48280397AGATTTGTTTACGTTTG-6.05
LHX2MA0700.1chr1:48280153-48280163GTTAATTAGT-6.02
RFX1MA0509.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG-7.36
RFX1MA0509.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG+7.37
RFX2MA0600.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG-7.68
RFX2MA0600.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG+7.77
RFX3MA0798.1chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG+7.64
RFX3MA0798.1chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG-7.6
RFX4MA0799.1chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG-6.94
RFX4MA0799.1chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG+7.53
RFX5MA0510.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG+7.84
RFX5MA0510.2chr1:48279973-48279989GGTTGCTATGGTAACG-7.91
mix-aMA0621.1chr1:48280152-48280163AGTTAATTAGT+6.14
Enhancer Sequence
GGGTTGCTAT GGTAACGGTG AACCGCAAGA GTGTCATTAC TAGAGCGCCT TGATTTTGAA 60
CAACAACGCA GCCGTCTCAT CTTTTAGGTG GGTAAATCCT ATCACAAAAT CGATGAAATG 120
TTAAGATAAC ATGTTACTCA AGTGTGTTTA CAAGTTTAGT GAGGTAACGT GCAGTTAAAG 180
AGTTAATTAG TGGTGAAGAT TGTATCTGTT TGCTGACATT GTATGAAAAC GGCAGTTAGC 240
GGCCGGTTGT GTTATATGAT AACTGCAAAG TTAACTTAAG GGCTCCACCA CGCTGAAATC 300
CTCTGTAAAC GTTATGTTTT TGTATTCAAG TTGTTAAAAA CGATAATAAT ATCACTTTTG 360
ATTGTATAAA TACACTTGGT TTAAGACGAG GGTTACAACG ACTGTAACAG ATTTGTTTAC 420
GTTTGGATTA CACAGAGCTG TCCCAGAGAT GCAGAACAGA TGTACGATAC TGTGCTGACA 480
CCCCACTAGC CTAGCAACTG CTAGAAGGGC TCTGACCAGA TAAAAAGGTC ATTAGGGGCA 540
TGCTGATCTG CAAAGCATTT AAAGGTAGAG TATGTAATGT TTCTATATTA TAACCCTCTG 600
TAAGTTAAAA AGGAAATCTG AAGAAAAAAT TA 632