EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01205 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:46446498-46447532 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr1:46447198-46447213TGCTATTTTTGGCAT-7.55
SP1MA0079.4chr1:46446883-46446898TAAGCCACGCCCCTA+6.9
SP4MA0685.1chr1:46446883-46446900TAAGCCACGCCCCTAAA+6.61
Enhancer Sequence
AATTTAGTTT AAGCCATACA TTTAGAGTTT TTTCTCATTT ATTCATTTCT TGTTAGGAAA 60
TGAAAATGGA TTTTGTTGTA TAAAACTGTA CATGCTGGTT CTTGTTAATA ATATAAAAAA 120
ACGTTCACTG ACAATGCAAA GCAAGCCCAC AAAAAGGCGG GACTTGGCAA TGCGGGTAGT 180
CTGGATGTTA TGATATCTGC AATTACATTC TACCTTGTCA CAAAGCTGAA TGCAGATATT 240
TCCAAAAAAA AGATTTTCCT TGTCAAAAAT CTGATTGAGA TATCTCTAGT GACATTGCAA 300
ATATCTTTAA ATTAGTTTTG ACTAGTCATA AAATTATTAT TACTAGTAAA TTGCAAGGGG 360
TATTTAATGC TAATATGGCT TACCATAAGC CACGCCCCTA AAGAGCGTAA ACCAATACTA 420
AAACAGAAAG CGCTGCTCAG CATCAGCATC ACTAGTAACT GGGAGAAAGG AGAGATGTGG 480
TGTTTGAGTT CTGTTCTTGT TGACACGGAT GAGAGGACAG ATATGTAGAA CTTCCAACAG 540
AGATTTACAC GATAAAACAA ACGTTATTAA CTGGTTTTGT GGCAGATAGC CAGCTATCAA 600
GTTAGCATAA TATGAACACA CAGCTGCGAT TTTCATCCGA TTTTCATTTA TTTTGTAGGG 660
GGAAGAGGTT TGGATAAACC TCTGGCGATC AGCAGTCGGA TGCTATTTTT GGCATGTCAG 720
AAATTTGGGT TTGGTCCTAC CTTGGAATCG CACAGTTGAA TAATATCAGC TGAGTAATTT 780
AAAGAATCTG TCATATAAAG ACATTAAAAG ATTTTGAAAA ATCAAAAAGC AAGATACTTT 840
ATTTTATTAG AGGATTTTAT TACTGGAAAA TCAAGCTAAT ACCAGCTCAA GCTGTGTTAT 900
GGAAGCTGGT GGTAACTGGT TAGAACACCC AATTCCAGCT TACTGTATAT GTTTGCAGTT 960
GCATAGGTTT CAATGGCAAA TTTAATCATC TATTTTCATT GGTAGATTTA ATGCTTTGTT 1020
GATTAATATT TTTT 1034