EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01193 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:46052012-46053369 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:46052444-46052460CCTTATGTACACAAAA+6.03
Foxd3MA0041.1chr1:46052743-46052755GTTTGTTTGTTT+6.32
RBPJMA1116.1chr1:46052193-46052203CCTGGGAAAG+6.02
Enhancer Sequence
CGTCCTCAGC CATTTAAATC GTAGAGCCAA CGCAAGGGAA AGGCTCGGTG AATGGCAACT 60
CAACAACAAA GCTTCGCTCC GTCGTATTTC CTCTTATGAA CGAAGGGAGC GCGAGCGGAG 120
CGATTGGCTA CGGAAAAAAA GAAAAGGCAG GTTTATGATA CTTACTTCAG GCTTGGAATA 180
ACCTGGGAAA GTGCAATTCC CTTTTAACGT GTACGTCGAG CCAATGGGGA GGATATTCCT 240
GTAGAAAGCC GGACTCCTAT CAGTGTGTCA CTGAAGCCTC TATTATTGCA ATTACGCCAA 300
GCTTCAAGGA AGTTGTCCTT TTGTTCCAGC ATTTATACAT TGCGTCAATG TTGCGAAAAG 360
AGGAGGAGGC GGAGCGGTGG CACTTGGAGT AAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAAAGAAGCG 420
AGCAGCACAC GACCTTATGT ACACAAAACC CAGACCCTCC ACCCTATAAC AAAATCGACG 480
GGATCAGATG AGATCACGTG TCCCCCCTCA CTGTACAGCT CAACTCATAC GGGGCAAGAT 540
GCGCGCTCGC TGGGGTGGGA AGCGCGAAGT GCCAGGCAAG TCTCCATCAG AGCGCTGCGA 600
TGACAAGCTC GAGCAGCTTA TACAGTGACA GCGAAAGCGG ATATCTTCAT TATGTGTTTG 660
TATGTGTGCT TGTTTAAATC TTTTAGCAGC ACATTTATTC GCGTTTTGCA AAGATGTATC 720
TGCTCCTTTT TGTTTGTTTG TTTGTTAAAT TTTCTACAGT TGTTTCAGTA ACGATCATCC 780
AGTTGCAAAT TCAGGTGAAT CGCCTAATGG CATTGTGTAT TTACAAACAT CTTAAATGTG 840
TTGTGCTGTA TAAGTAGATT CAGTACATAC ATGTATATAT GCATACGGTA CAGTTTGTAA 900
TGAATTGGAT TACTTTATGA AATGATGTAT GCTTGTCCAA CTGAATGAAC CGGACCATTG 960
CTTCAGTTAC AGCAGAGTTG CATCACGGAG TTTGCTAGTC GCTTTTCGCT CCGCGGCCAA 1020
TAAAGAGTCT AGAAGATACT CAATTAGATA ACCAATTGTT ATATATAAAA TTGTACTTAA 1080
CAAATATATC CACATGATTT AATCCAGATA CAAGCCTAGT TGAAAACCGT ACTCGTGAAT 1140
GCTGACTTTG ATGGCACTTT GATGACATCT CGTTCATTTG ATGAAGGTTT ACGCATTCTG 1200
CTCATGTTAT AAAACCTATT TTACAAACAT AACACACTTT ATAAGCAGTT TTACTGGAAA 1260
GGATTTTAAA ATCACACATC TAAGAGGCTA TAACAGCTAT GTTAGTGTAA GGGCCTGTTG 1320
AGTTCAGCTG AAGTGACCCT TTCCCAAAAA CTTCATG 1357