EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01182 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:45760755-45761713 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:45761522-45761533TTGACCTTGAA-6.14
HOXA13MA0650.2chr1:45761640-45761651GTTTTATGGGG-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:45761521-45761536CTTGACCTTGAATTC-6.29
PBX2MA1113.1chr1:45760815-45760827CCTGTCAATCAA-6.44
PBX3MA1114.1chr1:45760812-45760829GTGCCTGTCAATCAATT-6.29
Rarg(var.2)MA0860.1chr1:45761513-45761530TGTCCTTTCTTGACCTT-7.44
ZNF384MA1125.1chr1:45760756-45760768AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760918-45760930AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760919-45760931AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760917-45760929TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:45760916-45760928TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:45760915-45760927ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
CAAAAAAAAA AAAGGTTCTG TGGACTGGAT GTGTACACAT GTTATTATAG AAACATGGTG 60
CCTGTCAATC AATTTGGTGG GGCGGGGAAA CCACGCTCTT ACTTCCCGTT GCATTGGGCC 120
TCAAAATCAC TGGTATTTGG GTGCTATTGT AACGTTAAGA ATTAAAAAAA AAAAAACAGA 180
CACTCTTTGG GTTTCTAACA CTCCAATATG ACAGTGGACA CACTACAACT TTAATCAGTT 240
CTGTCCAAAC AGCATAAAGT TGATTTTCAT CATAGGTGCC CTTTAGACTA CGATATGTAA 300
TCGCTTTAAT GTCTTTTAGA AGCCTTGAAT GTAATATGGA GGGGGAAGTA TTAAAGCATT 360
AAACAACAGA ACTGTGACAA ACCTTCTTGC TGTGCTGGTT CGAGTCTTGG CTTTTTGTTT 420
GCTTTTATGT TTGTCCAATA TTGTGTTTGA GCATTGTTGT CTTTTATGAA TTGTTTCTCT 480
TCTTTAAAGT GCTATTCAGC TTCTGGGAAT TTAAAACAAA TGTAATTTTG TAATTCTGCT 540
TGTCGAACAC AAGATGTCGC CACGTTCCTC AAGCACAGAG TTCTGAGCTC CTCGAGGTAC 600
AGTCTTGATG CAGGTAATGC AGCACTACTC ATCCATGATT CTATCTACTA CATTTGTGTA 660
GTTTCATCCT TTGACGATAT CAAATTGTGT TTAATTTTTA TAAACGTCTG CAAAATAACG 720
ACTGAAAAAA TACAGAATTA ACCACGAACA AACCCAAATG TCCTTTCTTG ACCTTGAATT 780
CGATGATGAC TGCAGTGTAT TAAATGCCAT GCAGTTTTTT TTTTTCAAAT TATGACTGTT 840
TGACATATAT GACATGGATA TGACAACACA CCTGGTGAGT TTCAAGTTTT ATGGGGACTT 900
ACCACACACT AACGTATTTT TTAATACCTA ACTGTATTTT CCTCTGTTAC TTTTACTT 958