EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01149 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:44889662-44891610 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:44890976-44890987TTTTATTGCTT-6.32
Nr5a2MA0505.1chr1:44891061-44891076ATGGTCAAGGTCAGC+6.53
RXRBMA0855.1chr1:44889748-44889762AAGGTTAAAGTTCA+6.02
RXRGMA0856.1chr1:44889748-44889762AAGGTTAAAGTTCA+6.27
RxraMA0512.2chr1:44889748-44889762AAGGTTAAAGTTCA+6.18
Sox11MA0869.1chr1:44890815-44890830AACAATGAAATAGTT-6.91
ZNF24MA1124.1chr1:44891244-44891257CATTCATTCACTC+6.87
ZNF384MA1125.1chr1:44890056-44890068TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890057-44890069TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890058-44890070TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890059-44890071TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890060-44890072TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890061-44890073TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890062-44890074TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890063-44890075TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890064-44890076TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:44890065-44890077TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
CTCCAATAGT CATTAACGTG CATCCCTATG CAGCACAAAC ATCTTCTGAC TGTAGTTTTG 60
CTATTGCACA GCAGCAGGTT TGTAACAAGG TTAAAGTTCA AACTCCTGCC GTTTACAAAC 120
TGTAATGACT GTTGTGAGCT GCGATTGCCT CTGTATGATG GCAGGCATAT TTAATCGCTT 180
CAGATGAAGT AATTCTTTAG CTCATCAACT TTTTATACCG CTTTGTAATA ATTTATTATT 240
AACTTTCATG TGTCTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAGT 300
TAAATGGCTA AGAAATTGTT AAGTGTAATT AAATTGCTTG TGTTTTCTTG TGAGTTATTA 360
AAGGAGAAAT GAGTCCCTAA TATTCCAGTC ACTGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGGGAG 420
AGGGTCATTT AAAAAGTGGG TCATTCTGAA AGTCAGCCAA AATGTCACTT GGCATCTATA 480
ATGTTGGGTA TTTTATAAGC GCTGTAAAAC TATGTTGTCC ATATAGGCAG TCCTTGTTCT 540
AATTCACCTA AACATTTTTC AATGTCATCC TCTCGATCCT TTTCTGTCAT GTCTCAACAT 600
GTGACAGAAA GACATAATCT AAATTCAGTA CATTAAAACC ACTCAAAAGC CTACCTAAAG 660
CAAAAATATT CAAGATTAGA TAGCTGATAT CTCTATAAAA CTACATATTT GCACATATTT 720
CGTCAAAGCA AGATGGCATT TATGTCGTAA CTGATAAAGT TCTTGCAGAC AGTAAATACC 780
GTTTTCATAT ACTCACAGTG TCCTAACCAG ACATGACCAA AGCGCACATT AATCTGCGCT 840
TTGGTCCTAG CTATGACAAG CTACGGCACT GCATATTGCT CTGTCAGCTT TCCATTTCTG 900
TACATCAGGT AGTTCCGCCC ATTTACAGAT ACATCTAATA TAACGAATCC CTCAGTCTCT 960
TCAAGATTAT TACGAAATAC ATTGTCTAGA TGTCATCATG AAAACAAATT CACTTTCAAA 1020
TATTAGCAAT ATCCAGCAGT ACTGCGCAAA CACGCAGAGT GCAAGAGAAT GTGGAAACCA 1080
TGAGAACCAC ACACACACTA ATCTGATTAC ATGTGATTTT GTTGCATTGC GTGGCATATT 1140
CACTTTCAGA GTGAACAATG AAATAGTTGC ACTGCATCTG TTTTACACAC ATCTGCCTAG 1200
CAGCACTGCA CTCGATGTCA CTATTGTGCT AGCATAATCC ACAATCAATA TGTGCCTAGA 1260
TACACAATAA AATCAATCAA CAATTCTCAG GTGCATCCCT TGATCAGAAG AGATTTTTAT 1320
TGCTTAAGAT ATAAAATAAA TAGTTGTATT CTTCAATTTG TTTCTGTACA CATCCTTTTT 1380
TTTAAACGGT GGAAGGCCGA TGGTCAAGGT CAGCCGAGCA ACATGCTTCT AGCCTGAATT 1440
ATTTGAATAT TTCCATGTAC AGAAAGCATT GGCTTCTCAT AACGTACGGT CCCATTGGAA 1500
TAAAATAAAA AAATATGAGC ATAATACGGC ATCTCTAATG AAACCAATAA AGAGACTGTG 1560
TGCCATGAGG GTGCAAAAAT GACATTCATT CACTCTGCTG TTTTCATTGC TCTCTGTTGT 1620
TTCGGCTAGA TTTAGTTTTG AGTCACTTGG CTGTTTCTAT TGCAGTTTAT ATTAGATTTT 1680
TTTATGTCCC CAGTAAAAAT ATTTTCTAAA TGACCTGTAG GACCAATGTA TTGTCAAAAT 1740
GTCATTATCG AATTAGTTTG TCAACAAGGC GGCAAACCGA TCCATAGATT CTCAGTGTAA 1800
AGAATAGAAA CAGAATAAGA ACTAATACGG AAGAGGATAA ATAAACAAGT TGGTGGGAAT 1860
AAAAAAGTAC CACAACTCTC ATTTACACAA TTTGCTAAGT TTACTTTGGG CTATACAAAC 1920
ATTTTTGTTT TTCCTTTGCC TCAGTAGA 1948