EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-01117 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr1:43924138-43927259 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK2MA1103.1chr1:43925234-43925245CATGTTTACAT-6.14
IRF1MA0050.2chr1:43927127-43927148AACATGTTTCGCTTTCCCTTT+6.06
IRF3MA1418.1chr1:43927130-43927151ATGTTTCGCTTTCCCTTTCTT-7.03
Nkx3-2MA0122.3chr1:43924874-43924887TTTAAGTGGATTA-6.13
Enhancer Sequence
GACACAACAG ATCGGTTAGC GGAGAAACAA CCGTAGCAAA GTTCTTACAA AATGAACGGT 60
AGTAACCTAC CATACCAAGA AAACGACGCA ATTGCTTACG GTCCTTCGGA GAGGGAAAAT 120
CACAAATTGC AGTCACCTTA GCAGCAACTG GGCGCACTTC ACCATTACCA ATAACTTTTC 180
CCAGGTAATC AATAGTGGCT TTACCAAATT CACATTTGGC CAAGTTAACG GTAAGTTTAG 240
CTTCTGCCAA TCGATTAAAA ACCTGTCGAA GCAAACTCAT GTGCTCTTGC CATGTCGAAC 300
TATACAACAC TACATCATCC AGGTACGCTT CGCAATTTGG AACACCGGCC AACACGGTGT 360
TAACGAGCCG TTGAAAAGTG CTTGGAGCGT TTTTCATCCC GAATGCCATC ACCCTATAAT 420
TAAGAAAAGC ATCCGGGGTG ACAAATGCTG ATATTTCTCT AGCACGTTCA CTTAACCCCA 480
CTTGCCAATA TCCCTTTAAT AGATCGAGTT TCGAAACATA TGTAGCAGAA CCTACACGAT 540
CCACACAATC ATCTATTCTT GGCAAAGGAT AGCAGTCACT TTTAGTTACG GCATTTACAC 600
GACGATAATC TGTACAAAAT CTAAATGTGC CATCAGATTT CTCTACCAGC AGACACGGTG 660
AACTCCATGG ACTAGTACTA GACTCAGCAA TGTGATTTTC CAACATGTAC TCAACTTCCT 720
TCTGCAGAAG CGACCTTTTA AGTGGATTAA CACGATATGG ATGTTGTTTA ATCGGCTGGG 780
TAAAACCAAC ATCAATATCA TGCTCAATCA CTGAAGTTAA ACCAGGAATG TCACTGAACA 840
ACATTGGGAA ACTTCTCACT AACCCAATGA CTTCAGCTTT CTCAGTTTGA CTCAAGTGTG 900
GTAGTTTGCT AGTTAAATTT TCGAGCATCT CAGAGTTTTT CAACCTACCC TCAATGATAC 960
ATCTAGATGG TTCTACATCT TTTTCATCGA CTGGTTCAGA TGTAAACACA CCCACAGATA 1020
GAGACTCTTG AACAGGTGAC TGTATGACGT TTTTAACTTT CTCAGTATCC GACTTTCTCT 1080
CATAATAGGG TTTAATCATG TTTACATGAC AAACTCTCAG ACTTTTTCGA CGATCAGATG 1140
TATGGATAAC ATAATCTCGA TCTGACAGTT TCCTTTTGAT CTCGTAAGGG CCACTATAAC 1200
GAGCTTGCAA CGACCCACCA GATACTGGCA ATAACACTAA AACTTTGTCA CCAGGGCTAA 1260
AACTTCGTTC TCTCGCTTTC TTGTCGAACC AAGTTTTCAT CTTTTCTTGT GATTTTTCAA 1320
GGTTTTGCTT TGCCAATTCA CGAACTCTGT ATAGACGTGT ACGAAACTGT GAAAAATACT 1380
CCGGTACGGT GGTGCTTTTT GAATCAGAGA GCCACCTCTC TTTCAATACG GCCAAAGGGC 1440
CACGCAAATT GTAGCCAAAC ACGAGCTCTG CAGGGCTAAA GCCCAGTGAT TCTTGAATCA 1500
CCTCTCGTGA AGCGAAAAGC AACCATGGAA GTCCTTCCTC CCAATCTCCC TCAAGCTCAA 1560
AACAGTATGT ACGCAACATT GACTTTAAAG TCTGATGAAA CCTCTCTAAA GCACCTTGAC 1620
TTTCTGGATG ATACGCAGTG GAGACGTTAT GTTTTATACC AAGTCGTTTA AGTACTTGAG 1680
AAAACGTTCG AGATGTAAAA TTCGTTCCCT GATCACTCTG GAGAATTTTT GGCAAACCAA 1740
AGAGCGTGAA AAACTTGACC AACGCTTTGG TGATCGCTCT AGTGGTTACA GAACGCAAAG 1800
GAATTGCCTC TGGGAAACGT GTAGTCGCGC ACATAATCGT TAAAAGATAC TTAAAGCCAG 1860
ATTTTGAACG TGGAAGCGGT CCTACACAGT CGATTAAAAT GTGTTCAAAA GGCTCAGAAA 1920
CCATCGGAAT TGGATAAAGT GGTGCAGGTT TGATAGTTTG GTTGGGTTTT CCAACAACTT 1980
GACAAACGTG ACAAGTCTTA CAAAAACGTG CAACATCACG CTTTAATCCA GGCCAATAAA 2040
AGTTTCGCAA AATCCGATTG TATGTTTTTA AAATACCCAA GTGACCAGCT GAACCATTGT 2100
GTGCACAATC TAAAATCATG TCTCGGTAAT CTACTGGAAT TACGATTTGG TTAACTACAT 2160
TCCAGTCTTC AGAAGATTTT GGAGATACCC ACTTTCTCAT CAGAATGCCG TTTCTAAGAA 2220
AGTACATCTG AGGCGCACAC GTATTCTCCT GCTCTGGTCG AACTAATTCG AAAAGCGAAG 2280
TAAGAGTGGA GTCAGATTTT TGAGCGTCAA TTAACTTCTC GGGACACAAA GACAAATCAG 2340
CACAATCTAT AGCATCCTTC TCAGCACTCA CAGGAAACAG ATCTGCTTTT TCCTGTAAAG 2400
GGACAGAGAA CAAATCAGTT GTGTCAGAAT TTACCATGAA TGTGTCACAT AAATCAACGC 2460
TATCAGAAGT CTCAGCGGAT TTAATCATAG ATCGAGTAAG CACGCACGCA GCAAATACAT 2520
CCGGATACTT AAGCGCACAG TCATCAGTAC CAGCGAGTGG TACAGGAACA ACTTCAGGTG 2580
ACACGTTAAT ATCGCTCCAT ACACTACCTC CCGCTAAATC ATTGCCTAGA ATGAATGTTA 2640
CACCAGCAAT AGGAAGAGAA GCACGAACAC CGACGATCAC GTCACCGCTC ACTAATTCAG 2700
ACTGTAGACT GATTTTATGC AACGGAACAT CAGCAACTCC CATCTCAAAA CCGCGCACTA 2760
ATACCGCGCT ACCAGTGGCA GTTTCCTCTG ATAATGGCAA AACTCCTTTC AAAATTATGG 2820
AAAGACTTGC TCCAGTATCC CGCAAAATAC GTACAGGCAC AGGCTTACTC ATGCTGGAAA 2880
TGGACACAGT TCCATAGTGC AAGAAAGGCG CATAACCATC TTTAGTGGGA TTAAAATCGG 2940
ACTCGGACGT ACAGTTAAAA TTTGAACTAG AGTCAACAGA AATTAACCCA ACATGTTTCG 3000
CTTTCCCTTT CTTCCTCAAC ACTGGACAGC TTGCAATTAA ATGACTAGAA TTTTTGCAAT 3060
AAAAACAAGC CCTTTCATCA GTCGGAACAG TTGACCTAAT ACGGAGTGAT TTACGAGGTA 3120
G 3121